本发明提供了一种基于全基因组测序检测腺嘌呤单碱基编辑系统(Adenine base editor,ABE)脱靶效应的方法及其在基因编辑中的应用。所述腺嘌呤单碱基编辑系统由TadA:TadA*:Cas9的融合基因和gRNA两部分组分组成。其能催化靶位点处腺嘌呤(Adenine,A)至鸟嘌呤(Guanine,G)的高效置换,在人类疾病基因编辑治疗和疾病模型构建中有广泛的应用前景。为此,我们开发了首个能够检测ABE系统全基因组范围内脱靶效应的检测方法——EndoV‑seq。本发明提供的EndoV‑seq方法在基因编辑,尤其是基因编辑治疗领域,具有广泛的应用前景。
本发明提供了用于抑制HSV‑1复制和/或靶标序列表达的CRISPR/Cas9系统,包含Cas9蛋白和gRNA,所述gRNA的编码序列包括SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.6所示核苷酸序列中的一种或多种。本发明还提供了用于抑制HSV‑1复制和/或靶标序列表达的组合物、试剂盒。本发明采用的Cas9CRISPR/Cas9系统可有效抑制HSV‑1病毒复制、抑制HSV‑1病毒的靶标序列的表达,还可应用于治疗HSV‑1病毒感染或HSV‑1病毒诱导的癌症。
本发明提供了用于抑制HSV‑1复制和/或靶标序列表达的CRISPR/Cas9系统,包含Cas9蛋白和gRNA,所述gRNA的编码序列包括SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.6所示核苷酸序列中的一种或多种。本发明还提供了用于抑制HSV‑1复制和/或靶标序列表达的组合物、试剂盒。本发明采用的Cas9CRISPR/Cas9系统可有效抑制HSV‑1病毒复制、抑制HSV‑1病毒的靶标序列的表达,还可应用于治疗HSV‑1病毒感染或HSV‑1病毒诱导的癌症。