[发明专利]基于菘蓝全基因组开发的SSR引物组及其应用在审
申请号: | 202310569029.0 | 申请日: | 2023-05-19 |
公开(公告)号: | CN116463453A | 公开(公告)日: | 2023-07-21 |
发明(设计)人: | 隋春;孙天琦;周蕾 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院药用植物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100193 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 菘蓝全 基因组 开发 ssr 引物 及其 应用 | ||
1.菘蓝的SSR分子标记引物组合物,其特征在于,所述组合物包括8对引物中的至少1对,所述8对引物名称为SSRSL01、SSRSL02、SSRSL03、SSRSL04、SSRSL05、SSRSL06、SSRSL07和SSRSL08,所述8对引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1-SEQ IDNo.16所示。
2.试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含权利要求1所述的SSR分子标记引物组合物。
3.DNA芯片,其特征在于,所述DNA芯片包含权利要求1所述的SSR分子标记引物组合物。
4.权利要求1所述SSR分子标记引物组合物在下述任一种应用:
A1)在菘蓝遗传多样性分析中的应用;
A2)在菘蓝品种多样性分析中的应用;
A3)在菘蓝亲缘关系分析中的应用;
A4)在菘蓝品种鉴定中的应用;
A5)在构建菘蓝遗传图谱或DNA指纹图谱中的应用;
A6)在菘蓝种质资源改良中的应用;
A7)在菘蓝基因定位或功能基因挖掘中的应用;
A8)在菘蓝分子标记辅助育种中的应用。
5.权利要求2所述试剂盒在下述任一种应用:
A1)在菘蓝遗传多样性分析中的应用;
A2)在菘蓝品种多样性分析中的应用;
A3)在菘蓝亲缘关系分析中的应用;
A4)在菘蓝品种鉴定中的应用;
A5)在构建菘蓝遗传图谱或DNA指纹图谱中的应用;
A6)在菘蓝种质资源改良中的应用;
A7)在菘蓝基因定位或功能基因挖掘中的应用;
A8)在菘蓝分子标记辅助育种中的应用。
6.权利要求3所述DNA芯片在下述任一种应用:
A1)在菘蓝遗传多样性分析中的应用;
A2)在菘蓝品种多样性分析中的应用;
A3)在菘蓝亲缘关系分析中的应用;
A4)在菘蓝品种鉴定中的应用;
A5)在构建菘蓝遗传图谱或DNA指纹图谱中的应用;
A6)在菘蓝种质资源改良中的应用;
A7)在菘蓝基因定位或功能基因挖掘中的应用;
A8)在菘蓝分子标记辅助育种中的应用。
7.一种利用权利要求1所述SSR分子标记引物组合物进行菘蓝遗传多样性分析或亲缘关系分析的方法,其特征在于,所述方法包括:以待测菘蓝基因组DNA为模板,利用权利要求1所述的SSR分子标记引物组合物进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,对所述PCR扩增产物进行电泳检测,根据电泳检测结果进行菘蓝遗传多样性分析或亲缘关系分析。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,PCR扩增的程序为:96℃预变性5min;96℃变性10s,65℃退火30s,72℃延伸45s,共35个循环;最后72℃末端延伸10min。
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