[发明专利]tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用在审
申请号: | 202310446586.3 | 申请日: | 2023-04-24 |
公开(公告)号: | CN116536424A | 公开(公告)日: | 2023-08-04 |
发明(设计)人: | 刁文丽;丁梦;郭宏骞;刘光香;纪长威 | 申请(专利权)人: | 南京鼓楼医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;C12Q1/6851 |
代理公司: | 南京源古知识产权代理事务所(普通合伙) 32300 | 代理人: | 毕景峰 |
地址: | 210000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | trf 19 drmd5112 制备 细胞 诊断 试剂盒 中的 应用 | ||
1.tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,所述tRF-19-DRMD5112的具体序列为:5’-AATCCCGGACGAGCCCCCA-3’。
2.根据权利要求1所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,所述诊断试剂盒是以tRF-19-DRMD5112这一小RNA作为标志物对其在血浆中的表达量进行检测,对肾细胞癌进行早期诊断。
3.根据权利要求2所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,所述诊断试剂盒包括以下组分:针对tRF-19-DRMD5112的逆转录引物、针对tRF-19-DRMD5112的上游引物、针对U6的逆转录引物、针对U6的上游引物、通用引物、5×逆转录缓冲液、逆转录酶混合液和SYBR Green qPCR混合液。
4.根据权利要求3所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,针对tRF-19-DRMD5112的逆转录引物的序列为:
GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACTGGGGG。
5.根据权利要求3或4所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,针对tRF-19-DRMD5112的上游引物的序列为:
CGCGAATCCCGGACGAG。
6.根据权利要求5所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,针对U6的逆转录引物的序列为:
CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAGAACGCTTC。
7.根据权利要求6所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,针对U6的上游引物的序列为:
ACACTCCAGCTGGGACGCAAATTCGTGAAG。
8.根据权利要求7所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,通用引物的序列为:
AGTGCAGGGTCCGAGGTATT。
9.根据权利要求8所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,5×逆转录缓冲液和逆转录酶混合液来源于TAKARA的逆转录试剂盒(No.RR037A);SYBR Green qPCR混合液来源于南京诺唯赞生物科技股份有限公司的ChamQ SYBR qPCRMaster Mix试剂盒(No.Q711-02)。
10.根据权利要求9所述的tRF-19-DRMD5112在制备肾细胞癌诊断试剂盒中的应用,其特征在于,检测tRF-19-DRMD5112这一小RNA作为标志物在血浆中的表达量的方法,包括以下步骤:
步骤1:采集血液样本,离心获得血浆;
步骤2:通过酚-氯仿法提取血浆中的总RNA;
步骤3:使用TAKARA的逆转录试剂盒(No.RR037A)以及针对tRF-19-DRMD5112和U6的两种逆转录引物进行逆转录反应,分别获得tRF-19-DRMD5112和U6的cDNA;
步骤4:使用南京诺唯赞生物科技股份有限公司的ChamQ SYBR qPCR Master Mix试剂盒(No.Q711-02)以及针对tRF-19-DRMD5112和U6的两种上游引物和通用引物进行实时定量PCR反应,并通过荧光实时定量PCR技术分别检测各样本中tRF-19-DRMD5112和U6的表达丰度值,即Ct值;
步骤5:以U6为对照,计算ΔCt=CttRF-19-DRMD5112-CtU6;则血浆中tRF-19-DRMD5112的相对表达量为2-ΔCt。
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