[发明专利]一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用

说明书

本发明公开了一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记组合和应用，属于棉花育种技术领域。包括以下(1)‑(3)中至少一项所述的KASP分子标记组合：(1)与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的四个KASP分子标记；(2)与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的四个KASP分子标记；(3)与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的四个KASP分子标记。本发明能够实现多个纤维长度QTL的聚合鉴定，可以大幅度提高棉花品种的纤维长度，有助于棉花纤维长度分子标记辅助选择育种，促进棉花纤维长度改良。

技术领域

本发明涉及棉花育种技术领域，特别是涉及一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用。

背景技术

棉花是世界上重要的经济作物，其纤维是纺织工业重要的原材料。目前所应用的棉花栽培种主要是亚洲棉、海岛棉和陆地棉等。陆地棉原产于中美洲，具有适应性好、产量高、纤维长和品质优秀的特点。棉花的经济价值主要是用于制成各种各样的织布品，是世界上最主要的农作物之一。而棉花纤维长度的改善对提高棉花的经济价值有重要作用。

棉花的纤维长度性状属于数量性状，受多基因的控制。QTL作图是一种分析复杂数量性状遗传基础的有效工具，主要包括连锁分析和关联分析两种方法。连锁分析主要基于由遗传差异大的双亲构建的群体，具有很高的作图能力，但双亲群体缺乏遗传多样性和大量重组事件。关联分析主要基于通过广泛收集种质资源而获得的种质资源群体，该群体具有丰富的遗传变异和表型变异，可以检测到大量的QTL。目前已经在棉花中定位到了大量的与纤维长度有关的QTL，但是如何将这些纤维长度的QTL运用到棉花精准分子育种是个问题。

利用多亲本杂交群体可以将亲本拥有的纤维长度的QTL聚合到重组单株。聚合纤维长度QTL的重组单株可以用于育种。利用分子标记可以鉴定筛选单个纤维长度QTL的单株的存在与否，以及聚合多个纤维长度QTL的单株。

发明内容

本发明的目的是提供一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用，以解决上述现有技术存在的问题，本发明的KASP分子标记能够实现多个纤维长度QTL的聚合鉴定，可以大幅度提高棉花品种的纤维长度，为棉花植株优良品种的筛选提供了有力保障。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记组合，包括以下(1)-(3)中至少一项所述的KASP分子标记组合：

(1)与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP分子标记KASP-G41、KASP-G42、KASP-G43和KASP-G44；

(2)与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP分子标记KASP-G21、KASP-G22、KASP-G23和KASP-G24；

(3)与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP分子标记KASP-G31、KASP-G32、KASP-G33和KASP-G34；

所述KASP-G41的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,396,617bp，为C/T突变；

所述KASP-G42的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,437,416bp，为A/G突变；

所述KASP-G43的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,459,489bp，为C/T突变；

所述KASP-G44的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,469,638bp，为C/T突变；

所述KASP-G21的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,894,952bp，为C/G突变；

所述KASP-G22的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,890,951bp，为C/G突变；