[发明专利]一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记和应用在审
| 申请号： | 202310247574.8 | 申请日： | 2023-03-15 |
| 公开（公告）号： | CN116144827A | 公开（公告）日： | 2023-05-23 |
| 发明（设计）人： | 杜雄明;赵盈睿;何守朴;陈保军;潘兆娥;贾银华;庞保印;王静静 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院棉花研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京东方盛凡知识产权代理有限公司 11562 | 代理人： | 高天星 |
| 地址： | 455000 河南省安*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 棉花 纤维 长度 qtl 紧密 连锁 kasp 分子 标记 应用 | ||
1.一种与棉花纤维长度QTL紧密连锁的KASP分子标记组合，其特征在于，包括以下(1)-(3)中至少一项所述的KASP分子标记组合：
(1)与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP分子标记KASP-G41、KASP-G42、KASP-G43和KASP-G44；
(2)与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP分子标记KASP-G21、KASP-G22、KASP-G23和KASP-G24；
(3)与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP分子标记KASP-G31、KASP-G32、KASP-G33和KASP-G34；
所述KASP-G41的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,396,617bp，为C/T突变；
所述KASP-G42的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,437,416bp，为A/G突变；
所述KASP-G43的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,459,489bp，为C/T突变；
所述KASP-G44的SNP位点的物理位置为A07染色体的88,469,638bp，为C/T突变；
所述KASP-G21的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,894,952bp，为C/G突变；
所述KASP-G22的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,890,951bp，为C/G突变；
所述KASP-G23的SNP位点的物理位置为A09染色体的61,976,868bp，为C/T突变；
所述KASP-G24的SNP位点的物理位置为A09染色体的62,027,231bp，为C/G突变；
所述KASP-G31的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,669,170bp，为G/T突变；
所述KASP-G32的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,671,829bp，为C/G突变；
所述KASP-G33的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,676,672bp，为C/T突变；
所述KASP-G34的SNP位点的物理位置为D11染色体的24,567,513bp，为A/G突变。
2.一种与棉花纤维长度QTL中FL5区间紧密连锁的KASP引物对组合，其特征在于，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
3.一种与棉花纤维长度QTL中FL3区间紧密连锁的KASP引物对组合，其特征在于，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
4.一种与棉花纤维长度QTL中FL2区间紧密连锁的KASP引物对组合，其特征在于，所述KASP引物对组合包括如下表所示引物：
5.一种利用单个棉花纤维长度QTL分子标记鉴定棉花纤维长度性状的方法，其特征在于，包括以下步骤，
S1.利用如权利要求2-4任一项所述的KASP引物对组合对待测棉花材料进行KASP分子标记基因型分型检测；
S2.当能够读取到以下(1)-(3)任一项所述的扩增信号时，将所述待测棉花材料鉴定为棉花长纤维性状植株：
(1)当采用如权利要求2所述的KASP引物对组合时，所述KASP-G41、所述KASP-G42、所述KASP-G43和所述KASP-G44均检测到引物类型为X的扩增信号；
(2)当采用如权利要求3所述的KASP引物对组合时，所述KASP-G21、所述KASP-G22、所述KASP-G23和所述KASP-G24均检测到引物类型为Y的扩增信号；
(3)当采用如权利要求4所述的KASP引物对组合时，所述KASP-G31、所述KASP-G32、所述KASP-G33和所述KASP-G34均检测到引物类型为X的扩增信号。
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