[发明专利]一种水稻粒型QTL的InDel分子标记SG2-InDel、试剂、试剂盒及其应用

权利要求书

1.一种水稻粒型QTL的InDel分子标记SG2-InDel，其特征在于，所述InDel分子标记SG2-InDel的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；在所述SEQ ID NO.1中存在连续的3或4个重复序列；所述重复序列为GGCAGG。

2.一种用于检测权利要求1所述InDel分子标记SG2-InDel的试剂，其特征在于，所述试剂包括引物对；所述引物对包括SG2-InDel-F和SG2-InDel-R；

所述SG2-InDel-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；

所述SG2-InDel-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

3.一种检测水稻粒型的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求2所述的试剂。

4.根据权利要求3所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括dNTPs、Taq DNA聚合酶和含镁离子的10×Taqbuffer。

5.权利要求1所述的InDel分子标记SG2-InDel或权利要求2所述的试剂或权利要求3或4所述的试剂盒在检测和/或辅助检测水稻粒型中的应用。

6.权利要求1所述的InDel分子标记SG2-InDel或权利要求2所述的试剂或权利要求3或4所述的试剂盒在水稻粒型改良中的应用。

7.权利要求1所述的InDel分子标记SG2-InDel或权利要求2所述的试剂或权利要求3或4所述的试剂盒在选育和/或辅助选育细长粒型水稻品种中的应用。

8.一种检测水稻粒型的方法，其特征在于，包括以下步骤：

以待检测水稻的DNA为模板，利用权利要求2所述的试剂进行PCR扩增，得到扩增产物；

根据扩增产物的长度判断待检测水稻的粒型情况：

当所述扩增产物长度为89bp，则待测水稻的基因型为SG2，粒型为短粒；

当所述扩增产物的长度为95bp，则所述待测水稻的基因型为SG2-Nip，粒型表现为细长粒；

当所述扩增产物为95bp和89bp，则待测水稻的基因型为杂合型，粒型介于短粒和细长粒之间。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系以10μL计，包括1μL待检测水稻的DNA、0.5μLSG2-InDel-F、0.5μLSG2-InDel-R、1μL 10×Taqbuffer、0.2μLdNTPs、0.2μLTaq DNA聚合酶和余量ddH₂O。

10.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增的反应程序包括：95℃预变性3min；95℃变性15s、55℃退火15s、72℃延伸30s，共32个循环；72℃延伸10min。