[发明专利]高粱SbDW3基因的SNP分子标记及应用在审
| 申请号: | 202211501919.X | 申请日: | 2022-11-28 |
| 公开(公告)号: | CN115820914A | 公开(公告)日: | 2023-03-21 |
| 发明(设计)人: | 何振艳;景海春;许文秀;闫慧莉 | 申请(专利权)人: | 中国科学院植物研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
| 地址: | 100093 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 高粱 sbdw3 基因 snp 分子 标记 应用 | ||
1.应用,其特征在于:所述应用为P1或P2;
所述P1为检测SNP1和SNP2这两个SNP的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重中的应用,所述SNP1是高粱基因组的一个SNP,为序列表中SEQ IDNo.1的第1020位核苷酸,其为T或A;所述SNP2是高粱基因组的一个SNP,为序列表中SEQ ID No.1的第1021位核苷酸,其为T或A;
所述P2为检测单倍型的物质在鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重中的应用,所述单倍型是高粱一条染色体上所述SNP1和所述SNP2这两个SNP的多态性组合。
2.应用,其特征在于:所述应用为Q1、Q2、E1或E2;
所述Q1为检测SNP1和SNP2这两个SNP的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重产品中的应用;所述SNP1是高粱基因组的一个SNP,为序列表中SEQ IDNo.1的第1020位核苷酸,其为T或A;所述SNP2是高粱基因组的一个SNP,为序列表中SEQ IDNo.1的第1021位核苷酸,其为T或A;
所述Q2为检测单倍型的物质在制备鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重产品中的应用;所述单倍型是高粱一条染色体上所述SNP1和SNP2这两个SNP的多态性组合;
所述E1为检测SNP1和SNP2这两个SNP的多态性或基因型的物质在高粱育种或制备高粱育种产品中的应用;所述SNP1是高粱基因组的一个SNP,为序列表中SEQ ID No.1的第1020位核苷酸,其为T或A;所述SNP2是高粱基因组的一个SNP,为序列表中SEQ ID No.1的第1021位核苷酸,其为T或A;
所述E2为检测单倍型的物质在高粱育种或制备高粱育种产品中的应用;所述单倍型是高粱一条染色体上所述SNP1和SNP2这两个SNP的多态性组合。
3.产品,其特征在于所述产品含有权利要求1中所述检测高粱基因组SNP1和SNP2这两个SNP的多态性或基因型的物质的产品或含有权利要求1中所述检测单倍型的物质的产品,且可为下述G1)-G3)中的任一种:
G1)检测高粱地上部分干重相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
G2)鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的产品;
G3)用于高粱育种的产品。
4.鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的方法,所述方法为方法A或方法B:
所述方法A为鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的方法,包括检测待测高粱中权利要求1中所述SNP1和SNP2这两个SNP的基因型,根据所述待测高粱的所述两个SNP的基因型鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重:所述两个SNP的基因型为基因型TTTT的高粱的地上部分干重高于或候选高于基因型AATT和基因型AAAA的高粱,所述SNP1和SNP2这两个SNP的基因型为基因型AAAA的高粱和基因型AATT的高粱的地上部分干重无显著差异;所述基因型TTTT是所述SNP1的基因型为TT且所述SNP2的基因型为TT的两个SNP组合基因型;所述基因型AATT是所述SNP1的基因型为AA且所述SNP2的基因型为TT的两个SNP组合基因型;所述基因型AAAA是所述SNP1的基因型为AA且所述SNP2的基因型为AA的两个SNP组合基因型;
所述方法B为鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的方法,包括检测待测高粱中权利要求1中所述单倍型,根据所述待测高粱的单倍型鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重:单倍型SbDW3-Hap2对应的纯合基因型高粱地上部分干重高于或候选高于单倍型SbDW3-Hap1和单倍型SbDW3-Hap3对应的纯合基因型高粱;单倍型SbDW3-Hap3和单倍型SbDW3-Hap1对应的纯合基因型高粱地上部分干重无显著差异。所述单倍型SbDW3-Hap1为所述SNP1为A且所述SNP2为T的单倍型,所述单倍型SbDW3-Hap2为所述SNP1为T且所述SNP2为T的单倍型,所述单倍型SbDW3-Hap3为所述SNP1为A且所述SNP2为A的单倍型。
5.权利要求4所述的方法在高粱育种中的应用。
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