[发明专利]与高粱地上部分干重相关基因SbDW1的SNP分子标记及应用

说明书

本发明公开了与高粱地上部分干重相关基因SbDW1的SNP分子标记及应用。本发明涉及分子生物技术领域，具体涉及单倍型分子标记在鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重中应用。包括检测待测高粱基因组中SNP的多态性或基因型或高粱单倍型，根据所述基因型鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重，所述SNP1为序列表中SEQ ID No.1的第603位核苷酸，其为T或G；所述SNP2为序列表中SEQ ID No.1的第814位核苷酸，其为T或A。可将检测所述SNP多态性和基因型或高粱单倍型的物质与其他物质(如检测其他与高粱地上部分干重相关的分子标记的单核苷酸多态性或基因型的物质)联合在一起制备鉴定高粱地上部分干重的产品。

技术领域

本发明属于植物育种领域，具体涉及与高粱地上部分干重相关基因SbDW1的SNP分子标记及其应用。

背景技术

高粱(Sorghum bicolor)又叫蜀黍，为禾本科高粱属一年生草本植物，是世界五大谷物作物之一，属于C4作物，广泛种植于干旱、半干旱热带、亚热带和温带地区。全球范围内，高粱被用于动物饲料、饲料以及糖浆和生物乙醇等高价值产品。由于具有耐旱、耐涝和耐盐碱等特性，它在限制其他谷物种植的环境条件下成为高产作物，同时也是食物、饲料和酿造原料的重要来源，有望成为一种有前途的生物能源作物。

土地盐渍化是世界范围内广泛存在的问题，约20％的可用耕地已发生或正在发生不同程度的盐渍化，可用于作物种植的土地损失已成为农业可持续性的一个严重问题。盐分是最重要的环境压力之一，它极大地减少了可耕地面积，同时也降低了作物产量和质量，使用耐盐作物是缓解这一问题的一项重要战略。高粱此前被认为具有中度耐盐性，西部、东北的温带地区是高粱的主要种植地区，具有很强的抗旱、耐涝、耐盐碱、耐高温等特性，适宜在盐碱、干旱等边际土地上种植，高粱以其强大的抗逆性和广泛的适应性而闻名，耐盐性是其主要特征之一。因此，种植耐盐碱高粱品种是充分利用盐碱土地资源，提高高粱产量的有效措施。

分子标记辅助选择育种可在DNA水平针对目标性状进行选择，不仅结果稳定，而且可以在苗期进行选择，降低表型评价的成本，提高高粱育种效率。单核苷酸多态性(SNP)标记具有遗传稳定、数量多、分布广且易于检测等特点，适合于数量庞大的检测分析。通过遗传分析找到关键标记位点后，需要将其转化为易用的分子标记。KASP(Kompetitiveallele-specific PCR)，即竞争性等位基因特异性PCR技术，以其高度稳定性、准确性和低成本的特点，已经被广泛应用于高通量SNP分型检测。

因此，研究调控地上部分干重的基因，获得与地上部分干重基因紧密连锁的KASP分子标记，对高粱地上部分干重主效基因位点进行定位和检测，有效调控高粱的地上部分干重类型，选育预期地上部分干重类型的高粱新品种，对提高高粱产量具有极其重大的意义。目前，在高粱中开发与目标QTL紧密连锁的分子标记并申请专利应用的报道很少，且没有与地上部分干重相关的专利报道。

发明内容

本发明所要解决的问题是如何鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重性状或/和如何辅助进行高粱育种。

为了解决以上技术问题，本发明首先提供了检测高粱基因组中SNP的多态性或基因型的物质或检测单倍型的物质在如下任一中的应用，

(1)鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重；

(2)筛选或选育高地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种；

(3)筛选或选育低地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种；

(4)高粱育种；

(5)制备鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的产品；

(6)制备筛选或选育高地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种的产品；

(7)制备筛选或选育低地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种的产品；

(8)制备高粱育种的产品；