[发明专利]与高粱地上部分干重相关基因SbDW1的SNP分子标记及应用

权利要求书

1.检测高粱基因组中SNP的多态性或基因型的物质或检测单倍型的物质在如下任一中的应用，

(1)鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重；

(2)筛选或选育高地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种；

(3)筛选或选育低地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种；

(4)高粱育种；

(5)制备鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的产品；

(6)制备筛选或选育高地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种的产品；

(7)制备筛选或选育低地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种的产品；

(8)制备高粱育种的产品；

所述SNP为高粱基因组中的名称分别为SNP1和SNP2这两个SNP，所述SNP1为序列表中SEQ ID No.1的第603位核苷酸，其核苷酸种类为T或G，所述SNP2为序列表中SEQ ID No.1的第814位核苷酸，其核苷酸种类为T或A，所述单倍型是高粱一条染色体上所述SNP1和所述SNP2这两个SNP的多态性组合。

2.鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的方法，所述方法为方法A或方法B，

所述方法A为鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的方法，包括检测待测高粱中权利要求1中所述SNP的基因型，根据所述待测高粱的所述基因型鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重：所述基因型为TTTT的高粱的地上部分干重高于或候选高于基因型为TTAA的高粱和基因型为GGAA的高粱；所述TTTT是所述SNP1的基因型为TT(序列表中SEQ ID No.1的第603位核苷酸为T的纯合型)且所述SNP2的基因型为TT(序列表中SEQ ID No.1的第814位核苷酸为T的纯合型)的两个SNP组合基因型；所述基因型TTAA是所述SNP1的基因型为TT且所述SNP2的基因型为AA(序列表中SEQ ID No.1的第814位核苷酸为A的纯合型)的两个SNP组合基因型；所述基因型GGAA是所述SNP1的基因型为GG(序列表中SEQ ID No.1的第603位核苷酸为G的纯合型)且所述SNP2的基因型为AA的两个SNP组合基因型；

所述方法B为鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的方法，包括检测待测高粱中权利要求1中所述单倍型，根据所述待测高粱的单倍型鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重：单倍型SbDW1-Hap1对应的纯合基因型高粱地上部分干重高于或候选高于单倍型SbDW1-Hap2对应的纯合基因型高粱和单倍型SbDW1-Hap3对应的纯合基因型高粱；所述单倍型SbDW1-Hap1为所述SNP1为T且所述SNP2为T的单倍型，所述单倍型SbDW1-Hap2为所述SNP1为T且所述SNP2为A的单倍型，所述单倍型SbDW1-Hap3为所述SNP1为G且所述SNP2为A的单倍型。

3.根据权利要求1所述的应用或权利要求2所述的方法，其特征在于：所述高粱为高粱自交系。

4.权利要求2或3所述的方法在高粱育种中的应用。

5.高粱育种的方法，其特征在于：所述方法为M1和M2：

M1、所述方法包括检测高粱基因组中权利要求1中所述SNP的基因型，选择所述SNP的基因型为TTTT的高粱作为亲本进行育种，所述TTTT是所述SNP1为T的纯合型，且所述SNP2为T的纯合型，所述方法的育种的目包括选育高地上部分干重的高粱；

M2、所述方法包括检测高粱基因组中权利要求1中所述的单倍型的类型，选择单倍型SbDW1-Hap1的高粱作为亲本进行育种，所述单倍型SbDW1-Hap1为所述SNP1为T且所述SNP2为T的单倍型。

6.用于检测权利要求1中所述SNP的多态性或基因型的产品，所述产品含有权利要求1中所述物质，所述产品为任一种：

C1)检测高粱地上部分干重相关的单核苷酸多态性或基因型的产品；

C2)鉴定或辅助鉴定高粱地上部分干重的产品；

C3)用于高粱育种的产品；

C4)筛选或选育高地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种的产品；

C5)筛选或选育低地上部分干重的高粱单株或株系或品系或品种的产品。