[发明专利]小麦最大根长QTL QMrl.sau-3D连锁的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202210657907.X | 申请日: | 2022-06-10 |
公开(公告)号: | CN114807429B | 公开(公告)日: | 2023-02-14 |
发明(设计)人: | 马建;陈黄鑫;周界光;玄其京;曾照勇;唐华苹;江千涛;蒋云峰;魏育明;郑有良;兰秀锦 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京东方盛凡知识产权代理有限公司 11562 | 代理人: | 菅士腾 |
地址: | 611130 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 小麦 最大 qtl qmrl sau 连锁 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种与小麦最大根长QTL QMrl.sau-3D连锁的SNP分子标记在调控小麦最大根长性状中的应用,其特征在于,所述SNP分子标记与QMrl.sau-3D共定位于小麦基因组的3D染色体长臂上,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示,所述SNP分子标记的36bp处存在C/T突变。
2.一种扩增与小麦最大根长QTL QMrl.sau-3D连锁的SNP分子标记的引物组合,其特征在于,所述引物组合包括如SEQ ID NO.1-2所示的两条特异性上游引物和如SEQ ID NO.3所示的一条通用下游引物;
所述SNP分子标记与QMrl.sau-3D共定位于小麦基因组的3D染色体长臂上,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示,所述SNP分子标记的36bp处存在C/T突变。
3.一种如权利要求2所述的引物组合在制备鉴定小麦基因或其基因片段的芯片中的应用。
4.一种如权利要求2所述的引物组合在制备鉴定小麦基因或其基因片段的试剂盒中的应用。
5.一种鉴定小麦基因或其基因片段的芯片,其特征在于,包含权利要求2所述的引物组合。
6.一种鉴定小麦基因或其基因片段的试剂盒,其特征在于,包含权利要求2所述的引物组合。
7.一种如权利要求2所述的引物组合、权利要求5所述的芯片或权利要求6所述的试剂盒在调控小麦最大根长性状中的应用。
8.一种筛选含有最大根长QTL QMrl.sau-3D的小麦株系的方法,其特征在于,以待测植株样品的基因组DNA作为模板,利用权利要求2所述的引物组合进行荧光定量PCR扩增,利用扩增结果进行基因型分型;将能够读取到SEQ ID NO.2所标记的荧光基团的植株鉴定为含有小麦最大根长QTL QMrl.sau-3D的植株。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述荧光定量PCR扩增的反应体系为:5μLMaster Mix,5ng模板DNA,1.4μL混合引物,ddH2O加至总量为10μL,所述混合引物由120μL10ng/μL的SEQ ID NO.1所示的特异性上游引物、120μL 10ng/μL的SEQ ID NO.2所示的特异性上游引物和300μL 10ng/μL的SEQ ID NO.3所示的通用下游引物,添加460μLddH2O进行混合得到。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述荧光定量PCR扩增的反应程序为:94℃预变性15min;94℃变性20s,61℃复性/延伸60s,共10个循环;94℃变性20s,55℃复性/延伸60s,共26个循环。
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