[发明专利]一种位于SREBF2基因的与番鸭性早熟性状相关的SNP分子标记及应用

说明书

本发明公开了一种位于SREBF2基因的与番鸭性早熟性状相关的SNP分子标记及应用，涉及生物技术领域；所述分子标记为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4；所述SNP1位于SEQIDNO:1所示序列的68bp，碱基为C或T；所述SNP2位于SEQIDNO:1所示序列的409bp，碱基为T或C；所述SNP3位于SEQIDNO:1所示序列的415bp，碱基为G或A；所述SNP4位于SEQIDNO:1所示序列的636bp，碱基为G或A。本发明发现了SREBF2基因的4个SNP位点，并将其与番鸭性早熟性状关联分析，为分子标记辅助选择提供新的SNP分子标记。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种位于SREBF2基因的与番鸭性早熟性状相关的SNP分子标记及应用。

背景技术

繁殖性能与番鸭的饲养成本息息相关，番鸭产蛋量越高，意味着饲养成本更低，能够带来更高的经济价值。同时番鸭蛋也是非常好的蛋白质商品，番鸭蛋富含钙、锌和铁，更适合用于烘焙。开产日龄、产蛋量、蛋重和受精率等是番鸭繁殖性能的关键指标，繁殖性状作为复杂的微效多基因控制的数量遗传性状，不仅受到许多基因的调控，还受到饲养条件等环境因素的影响。多个繁殖性能指标中，开产日龄的遗传力较高，规模化养殖能够很好的控制饲养环境以便符合番鸭的生理需求，从基因上进行改良能够带来更好的效果。开产日龄早代表着性早熟，性早熟个体在饲养周期内更早的进入产蛋高峰，产蛋周期内产生更多的种蛋，带来更高的经济价值。而开产日龄晚则意味着性晚熟，会导致受精率降低，产蛋高峰持续时间短，较早的进入衰退期，不利于产蛋周期内种蛋的获取。因此在育种过程中，根据开产日龄进行选择有利于提高番鸭的繁殖性能。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)是指基因组水平上由于随机的某个单核苷酸的变异引起的DNA序列的多态性，广泛存在于动植物基因组中。基因外显子和内含子的SNP可能会影响基因转录调控，转录本剪接，蛋白质翻译和剪辑修饰等，从而影响基因的表达效率，进而对表观性状产生影响。因此SNP定位表型性状后，可作为分子标记用于分子标记辅助育种选择。

目前可用于番鸭育种选择，尤其是对于繁殖性状育种选择的分子标记较少，大大限制了番鸭繁殖性能的育种进展。

发明内容

本发明的目的是提供一种位于SREBF2基因的与番鸭性早熟性状相关的SNP分子标记及应用，以解决上述现有技术存在的问题，本发明发现了SREBF2基因的4个SNP位点，并将其与番鸭性早熟性状关联分析，为分子标记辅助选择提供新的SNP分子标记。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明提供一种与番鸭性早熟性状相关的SNP分子标记，所述分子标记为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4；所述SNP1位于SEQ ID NO:1所示序列的68bp，碱基为C或T；所述SNP2位于SEQ ID NO:1所示序列的409bp，碱基为T或C；所述SNP3位于SEQ ID NO:1所示序列的415bp，碱基为G或A；所述SNP4位于SEQ ID NO:1所示序列的636bp，碱基为G或A。

进一步地，所述SNP1的基因型为CC、TT或CT；所述SNP2的基因型为TT、CC或TC；所述SNP3的基因型为GG、AA或GA；所述SNP4的基因型为GG、AA或GA。

本发明还提供一种利用的SNP分子标记鉴别番鸭性早熟性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)提取待测番鸭基因组DNA，进行PCR扩增，获得核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的扩增产物；

(2)对所述扩增产物测序；

(3)上述的SNP1、SNP2、SNP3和SNP4组成单倍型块，当所述单倍型块的基因型为AATT/AATT，则番鸭开产日龄早。

进一步地，在步骤(1)中，所述PCR扩增的引物对序列为SEQ ID NO:2-3所示序列。