本发明公开了一种与番鸭繁殖性状相关的分子标记及应用,属于生物技术领域。该分子标记包括SNP3和SNP4,其中,所述SNP3位于如SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的g.254GA位点,碱基突变为G或A;所述SNP4位于如SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的g.270CT位点,碱基突变为C或T。本发明通过分析TAT基因,发现该基因外显子区有多个与番鸭繁殖性能显著相关的SNP位点,为MAS提供新的SNP分子标记,且该分子标记可以准确的鉴定白番鸭不同周龄的繁殖性状,以为番鸭的选育提供科学数据。
本发明公开了一种基于LAMP检测鸡隐性白羽基因携带者的引物、试剂盒以及应用,属于分子生物技术领域,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1‑8所示。本发明以家鸡基因组DNA为扩增模板,利用本发明公开的引物组、通过本发明公开的扩增体系与扩增条件后,仅通过扩增反应体系的颜色变化就能判定样品中是否携带隐性白羽基因;该方法基于8条引物进行扩增,检测的特异性和准确率高;此外,该方法仅需恒温水浴锅或恒温金属板,无需进行PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳,无需专业设备,对检测人员的专业技术要求较低,极大地降低了隐性白羽基因检测的技术门槛,对于家鸡群体的隐性白羽基因筛查和淘汰隐性白羽基因携带者个体具有重要意义。
本发明公开了一种与麻黄鸡繁殖性状相关的分子标记及其应用,属于分子标记领域。上述分子标记如SEQ ID NO:1所示,SEQ ID NO:1所示序列存在如下SNP突变:第984位存在AG突变,基因型为AA、AG和GG;第1033位存在AG突变,基因型为AA、AG和GG;第1112位存在SNP突变,基因型为AA、AC、AG、AT、CC、CG、CT、GT和TT;以及第1196位存在TC突变,基因型为TT、TC和CC。本发明通过实验验证上述分子标记可以准确鉴定不同周龄的麻黄鸡繁殖性状,为分子标记辅助选择育种提供了新的分子标记。
本发明公开了一种与鸡屠体性状相关的EGR1基因分子标记、试剂盒及其应用,属于生物技术领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述核苷酸序列的第736位为SNP位点,存在G/C突变;所述SNP位点存在CC、GC、GG三种基因型。利用该分子标记检测鸡的基因组DNA,经过试验发现,EGR1基因序列的一个SNP位点rs313977419G>C,该SNP位点与鸡的屠体性状呈显著相关。因此,本发明可以准确鉴定鸡屠体性状,为分子标记辅助选择育种提供新的分子标记。
本发明公开了一种与鸡皮肤黄度相关的LncEDCH1基因分子标记及其应用,属于分子标记技术领域。所述LncEDCH1基因分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过分析LncEDCH1基因,发现该基因有多个SNP位点,通过对SNP位点进行基因分型并与皮肤黄度关联分析,筛选出了3个与胸部黄度值、腹部黄度值、肩部黄度值和腿部黄度值等肤色性状显著相关的SNP位点,上述3个SNP位点可以准确鉴定鸡肤色性状,为分子标记辅助选择育种提供新的分子标记。
本发明公开了与鸡皮肤乌度相关的TYR基因分子标记及其应用,属于家禽育种领域。本发明对五黑鸡的血液样本进行研究,发现TYR基因的第一外显子上存在两个与五黑鸡翅下胸部皮肤乌度显著关联的SNP位点,两个SNP位点分别为SNP1和SNP2,SNP1为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052532.1:g667TC,SNP2为如SEQ ID NO:1所示序列存在NC_052532.1:g759TC。经试验发现,上述两个位点与五黑鸡皮肤乌度显著相关,可作为五黑鸡皮肤乌度选育的分子标记,辅助五黑鸡皮肤乌度性状的早期筛选,这对推进五黑鸡品种的选育和鸡皮肤乌度研究具有积极意义。
本发明公开了一种与鸡屠体性状相关的LncEDCH1基因分子标记及其应用,属于分子标记技术领域。所述LncEDCH1基因分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明通过分析LncEDCH1基因,发现该基因有多个SNP位点,通过对SNP位点进行基因分型并与屠体性状关联分析,筛选出了5个与鸡胸肌率、腿比率、胫长、肌间脂肪宽和腹脂重等屠体性状显著相关的SNP位点,上述5个SNP位点可以准确鉴定鸡屠体性状,为分子标记辅助选择育种提供新的分子标记。
本发明公开了一种用于检测麻鸭隐性白羽基因的方法及其应用,属于生物技术领域。本发明提供用于检测麻鸭隐性白羽和非白羽等位基因的引物组,该引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑3所示。本发明利用该引物组,建立了用于鉴定鸭隐性白羽基因的PCR分子检测技术。本发明所构建的分子检测技术,除可提高麻鸭群体外观整齐度、满足生产和市场要求外,还可以尝试通过分离、建立隐性白羽麻鸭群,并将其作为其他品种的改良材料。
本发明公开了一种与黄羽肉鸡腿部皮肤黄度相关的分子标记及其应用。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述分子标记的突变位于其非编码序列内含子NC_006088.5:g.11346195GA处;本发明发现由于CD36基因内含子区域突变影响黄羽肉鸡的腿部皮肤黄度;因此,所述分子标记可应用于选育腿部皮肤黄度较高的个体,包括如下步骤:S1.提取待检测黄羽肉鸡的DNA;S2.目的片段的获得及测序:利用正反向引物对通过PCR扩增待测鸡的DNA,将获得的产物进行测序,分析序列碱基;S3.根据分析结果,育种时选择保留判定为GG基因型的个体。该分子标记有利于选育优势纯合基因型黄羽肉鸡,剔除腿部皮肤黄度较低的个体,提高鸡的腿部皮肤黄度。
本发明公开了一种与鸡黑色腹膜性状相关的DCT基因分子标记及应用,属于生物技术领域。所述DCT基因分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述DCT基因分子标记的192bp处存在SNP位点,所述SNP位点为C/T突变。本发明通过分析DCT基因,发现该基因存在多个SNP位点,并且通过试验验证:位点NM_204935.1:g.147917450CT与鸡黑色腹膜性状存在显著相关(P0.05),为MAS提供新的SNP分子标记,同时为鸡的选育提供科学依据。
本发明公开了一种与鸡鹿角冠性状相关的分子标记及其应用,属于动物遗传育种技术及分子生物学领域。所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。根据所述分子标记设计核苷酸序列如SEQ ID NO:2‑3所示的引物组,以及核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示的Taqman探针,通过实时荧光定量核酸扩增即可完成对鸡鹿角冠的分离鉴定,利用本发明的方法还可筛选杂合鹿角冠基因型,对鹿角冠性状辅助选择育种具有重要价值。