[发明专利]炎症性肠病标志微生物及其应用

权利要求书

1.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括适于检测第一微生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第一微生物集由以下菌种组成：动物双歧杆菌(Bifidobacterium_animalis)和布氏瘤胃球菌(Ruminococcus_bromii)。

2.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，进一步包括适于检测第二微生物集中的至少一种菌种的试剂，所述第二微生物集由以下菌种组成：分叉双歧杆菌(Bifidobacterium_bifidum)、爱格士菌(Eggerthella_unclassified)、嗜热链球菌(Streptococcus_thermophilus)、梭菌细菌(Clostridiaceae_bacterium_)JC118、柑橘梭菌(Clostridium_citroniae)和瘤胃球菌科细菌(Ruminococcaceae_bacterium_)D16。

3.根据权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第一微生物集中全部所述菌种的试剂。

4.根据权利要求2所述的试剂盒，其特征在于，包括适于检测所述第二微生物集中全部所述菌种的试剂。

5.试剂在制备试剂盒中的用途，所述试剂适于检测第一微生物集中的至少一种菌种，所述试剂盒用于诊断炎症性肠病或者检测炎症性肠病的治疗效果，所述第一微生物集由以下菌种组成：动物双歧杆菌(Bifidobacterium_animalis)和布氏瘤胃球菌(Ruminococcus_bromii)。

6.根据权利要求5所述的用途，其特征在于，所述试剂进一步适于检测第二微生物集中的至少一种菌种，所述第二微生物集由以下菌种组成：分叉双歧杆菌(Bifidobacterium_bifidum)、爱格士菌(Eggerthella_unclassified)、嗜热链球菌(Streptococcus_thermophilus)、梭菌细菌(Clostridiaceae_bacterium_)JC118、柑橘梭菌(Clostridium_citroniae)和瘤胃球菌科细菌(Ruminococcaceae_bacterium_)D16。

7.一种用于预防或者治疗炎症性肠病的药物组合物或者食品组合物，其特征在于，含有第一微生物集中的至少一种菌种，所述第一微生物集由以下菌种组成：动物双歧杆菌(Bifidobacterium_animalis)和布氏瘤胃球菌(Ruminococcus_bromii)。

8.一种确定个体是否患有炎症性肠病的方法，其特征在于，包括：

(1)确定所述个体的粪便样本中标志微生物的丰度，所述标志微生物包括第一微生物集和第二微生物集中的至少一种菌种；

(2)将步骤(1)中得到的所述丰度与预定的阈值进行比较，以便确定所述个体是否患有炎症性肠病；

其中，所述第一微生物集由以下菌种组成：动物双歧杆菌(Bifidobacterium_animalis)和布氏瘤胃球菌(Ruminococcus_bromii)；

所述第二微生物集由以下菌种组成：分叉双歧杆菌(Bifidobacterium_bifidum)、爱格士菌(Eggerthella_unclassified)、嗜热链球菌(Streptococcus_thermophilus)、梭菌细菌(Clostridiaceae_bacterium_)JC118、柑橘梭菌(Clostridium_citroniae)和瘤胃球菌科细菌(Ruminococcaceae_bacterium_)D16。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，步骤(1)进一步包括：

获得所述个体的粪便样本中的核酸测序数据；

将所述测序数据与参考基因组进行比对；

基于所述比对的结果，确定所述标志微生物的丰度。