[发明专利]一种利用数字PCR技术检测鲈弹状病毒的试剂盒及方法在审

专利信息
申请号: 202110972334.5 申请日: 2021-08-24
公开(公告)号: CN113637802A 公开(公告)日: 2021-11-12
发明(设计)人: 林强;李宁求;黄丹妮;付小哲;刘礼辉;梁红茹;罗霞;牛银杰 申请(专利权)人: 中国水产科学研究院珠江水产研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 颜希文
地址: 510170 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 利用 数字 pcr 技术 检测 弹状病毒 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种利用数字PCR技术检测鲈弹状病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括引物和特异性探针,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;所述特异性探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。

2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括无RNA酶的蒸馏水、一步法ddPCR探针法预混液、探针法ddPCR微滴发生油、质控液、阴性对照和阳性对照。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述一步法ddPCR探针法预混液包括:DNA聚合酶预混液、上游引物、下游引物、特异性探针和无RNA酶蒸馏水。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述一步法ddPCR探针法预混液的总体积为950μL时具体包括:500μL DNA聚合酶预混液、50μL上游引物、50μL下游引物、50μL特异性探针和300μL的无RNA酶蒸馏水。

5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照为含有鲈弹状病毒基因组的质粒;所述阴性对照为无RNA酶蒸馏水。

6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述引物和特异性探针的浓度均为10μM。

7.一种利用数字PCR技术检测鲈弹状病毒的方法,其特征在于,所述方法为利用权利要求1-6任一项所述的试剂盒通过数字PCR技术进行检测。

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述检测鲈弹状病毒的方法具体包括以下步骤:

(1)提取待测样品的总RNA,反转录成cDNA,作为PCR反应模板;

(2)配制ddPCR反应液,体积20μL,其配方为:一步法ddPCR探针法预混液18μL,待测样品cDNA模板为2μL;

(3)制备微滴,按照液滴发生板上标记位置,分别在样品孔和油位孔加入ddPCR反应液20μL和微滴发生油70μL,然后将固定有微滴发生卡的底座置于微滴发生仪中生成微滴;将液滴生成孔中生成的微滴以一一对应的方式全部转入96孔板,用热封仪进行封膜;

(4)将封好膜的96孔板转入PCR仪中进行扩增;

(5)将完成PCR扩增的PCR板放入微滴分析仪中,使用微滴分析仪检测微滴进行读数,分析每管反应体系中发出荧光的微滴数,显示样品中鲈弹状病毒检测结果。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(4)中所述扩增的程序为:95℃预变性10min;94℃变性30秒,53-65℃退火60秒,共40个循环;98℃10min,4℃恒温,结束反应,每步都设置2.5℃/秒的降温速度。

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述退火的温度为59℃。

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