[发明专利]一种利用数字PCR技术检测鲈弹状病毒的试剂盒及方法在审
申请号: | 202110972334.5 | 申请日: | 2021-08-24 |
公开(公告)号: | CN113637802A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 林强;李宁求;黄丹妮;付小哲;刘礼辉;梁红茹;罗霞;牛银杰 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 颜希文 |
地址: | 510170 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 数字 pcr 技术 检测 弹状病毒 试剂盒 方法 | ||
1.一种利用数字PCR技术检测鲈弹状病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括引物和特异性探针,所述引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;所述特异性探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括无RNA酶的蒸馏水、一步法ddPCR探针法预混液、探针法ddPCR微滴发生油、质控液、阴性对照和阳性对照。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述一步法ddPCR探针法预混液包括:DNA聚合酶预混液、上游引物、下游引物、特异性探针和无RNA酶蒸馏水。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述一步法ddPCR探针法预混液的总体积为950μL时具体包括:500μL DNA聚合酶预混液、50μL上游引物、50μL下游引物、50μL特异性探针和300μL的无RNA酶蒸馏水。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照为含有鲈弹状病毒基因组的质粒;所述阴性对照为无RNA酶蒸馏水。
6.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述引物和特异性探针的浓度均为10μM。
7.一种利用数字PCR技术检测鲈弹状病毒的方法,其特征在于,所述方法为利用权利要求1-6任一项所述的试剂盒通过数字PCR技术进行检测。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述检测鲈弹状病毒的方法具体包括以下步骤:
(1)提取待测样品的总RNA,反转录成cDNA,作为PCR反应模板;
(2)配制ddPCR反应液,体积20μL,其配方为:一步法ddPCR探针法预混液18μL,待测样品cDNA模板为2μL;
(3)制备微滴,按照液滴发生板上标记位置,分别在样品孔和油位孔加入ddPCR反应液20μL和微滴发生油70μL,然后将固定有微滴发生卡的底座置于微滴发生仪中生成微滴;将液滴生成孔中生成的微滴以一一对应的方式全部转入96孔板,用热封仪进行封膜;
(4)将封好膜的96孔板转入PCR仪中进行扩增;
(5)将完成PCR扩增的PCR板放入微滴分析仪中,使用微滴分析仪检测微滴进行读数,分析每管反应体系中发出荧光的微滴数,显示样品中鲈弹状病毒检测结果。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(4)中所述扩增的程序为:95℃预变性10min;94℃变性30秒,53-65℃退火60秒,共40个循环;98℃10min,4℃恒温,结束反应,每步都设置2.5℃/秒的降温速度。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述退火的温度为59℃。
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