[发明专利]一种用于鉴别青脆李品种的SSR分子标记引物及其应用

说明书

本发明公开了一种用于鉴别青脆李品种的SSR分子标记引物及其应用，解决了现有技术中青脆李依靠形态特征鉴别信息收集耗时耗力、准确度较低，由于李属植物种间杂交，使得同工酶、花粉微观形态以及染色体核型等方法使用受阻的技术问题。它包括3个SSR分子标记，并提供了一种用于毛细管电泳平台检测所需的SSR分子标记的引物对以及所述SSR分子标记用于鉴别青脆李的方法。本发明采用SSR分子标记与荧光毛细管电泳法鉴别青脆李品种，适用于青脆李的遗传多样性检测、遗传种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位与标记辅助育种等多个领域，为青脆李的鉴别提供了一种实验操作简便、反应高效、分析结果准确且成本较低的方式。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域，具体涉及一种用于鉴别青脆李品种的SSR分 子标记引物及其应用。

背景技术

青脆李是四川地区的一个品种系列，以肉质疏脆、果皮青绿、离核为主要 特征。由于青脆李品种丰富且具有异花授粉的特性，品种间杂交普遍，中间类 型多，品种的界限模糊，再加上不同地区之间的长期引种，导致“同物异名” 或“同名异物”现象较为严重。尤其是栽培较多的田坎麻李、大白李、羌脆李、 巴山脆李在生产上严重混淆，给青脆李的种质资源保存、评价、创新和利用带 来极大的不便。

在现有的技术中，青脆李品种的鉴别主要依赖于生育与形态特性，通过比 较植株的叶片、花和果实等形态特征来区别，费时费力，提供的有效辨识信息 却非常有限。此外，李属植物种间杂交产生的基因渐渗也会导致不同种或品种 表型性状趋于相似，造成种或品种的混淆。发展的同工酶、花粉微观形态以及 染色体核型等鉴别方法也同样面临着诸多问题。

SSR分子标记是一种成熟的分子标记技术,被广泛应用于遗传多样性检测、 种质鉴定、连锁图谱构建、基因定位与标记辅助育种等多个领域，具有多态性 丰富、操作简单、结果可靠、重复性好等优点，能够将其用于青脆李的品种鉴 别。

但是迄今为止,国内外对SSR分子标记用于鉴别青脆李品种的研究鲜见报 道，没有适用于青脆李鉴别的SSR分子标记引物，同时传统的SSR操作常配合 聚丙烯酰胺凝胶电泳与其他的生物技术进行基因的多态性分析，这些操作耗时 且不同等位变异难以准确识别、不同批次反应数据难以统一处理。

发明内容

本发明的目的在于提供一种用于鉴别青脆李品种的SSR分子标记引物及其 应用，解决了现有技术中缺乏适用于青脆李鉴别的SSR分子标记引物的技术问 题。

为实现上述目的，本发明首先根据已知的李属植物分子标记的三个DNA序 列(具体见图13-15)设计出50对引物，通过大量筛选，选择出了3对多态性 与重复性良好的SSR分子标记引物，将其用于田坎麻李、大白李、羌脆李、巴 山脆李四个品种的传多样性检测、种质鉴定、连锁图谱构建、基因定位和标记 辅助育种。

本发明提供的一种用于鉴别青脆李品种的SSR分子标记引物，包括引物对 PSR1-eg、PSR2-eg和PSR3-eg，其中：

引物对PSR1-eg的序列分别为：

上游引物PSR1-egF：CAGTTTGATTTGTGTGCCTCTC，

下游引物PSR1-egR：GATCCACCCTTTGCATAAAATC；

引物对PSR2-eg的序列分别为：

上游引物PSR2-egF：GCCACCAATGGTTCTTCC，

下游引物PSR2-egR：AGCACCAGATGCACCTGA；

引物对PSR3-eg的序列分别为：

上游引物PSR3-egF：ACGGTATGTCCGTACACTCTCCATG，

下游引物PSR3-egR：CAACCTGTGATTGCTCCTATTAAAC。