[发明专利]一种用于鉴别青脆李品种的SSR分子标记引物及其应用在审
申请号: | 202110925042.6 | 申请日: | 2021-08-12 |
公开(公告)号: | CN113481319A | 公开(公告)日: | 2021-10-08 |
发明(设计)人: | 刘佳;张国薇 | 申请(专利权)人: | 四川省农业科学院园艺研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 成都金英专利代理事务所(普通合伙) 51218 | 代理人: | 袁英 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴别 青脆李 品种 ssr 分子 标记 引物 及其 应用 | ||
1.一种用于鉴别青脆李品种的SSR分子标记引物,其特征在于:包括引物对PSR1-eg、PSR2-eg和PSR3-eg,其中:
引物对PSR1-eg的序列分别为:
上游引物PSR1-egF:CAGTTTGATTTGTGTGCCTCTC,
下游引物PSR1-egR: GATCCACCCTTTGCATAAAATC;
引物对PSR2-eg的序列分别为:
上游引物PSR2-egF: GCCACCAATGGTTCTTCC,
下游引物PSR2-egR:AGCACCAGATGCACCTGA;
引物对PSR3-eg的序列分别为:
上游引物PSR3-egF: ACGGTATGTCCGTACACTCTCCATG,
下游引物PSR3-egR: CAACCTGTGATTGCTCCTATTAAAC。
2.一种利用权利要求1所述的SSR分子标记引物鉴别青脆李品种的方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)提取待测样品的DNA;
2)以步骤1)提取的DNA为模板,利用SSR分子标记的引物组,对其进行一次PCR扩增;
3)以步骤2)一次PCR扩增产物为基础,用带荧光的SSR分子标记引物组在与一次PCR扩增相同的体系与程序进行二次PCR扩增,采取荧光毛细管电泳系统检测二次PCR扩增产物,得到二次PCR扩增产物的荧光毛细管电泳图;
4)将步骤3)中获得的待测样品的二次PCR扩增产物荧光毛细管电泳图与青脆李标准图谱对照,鉴别青脆李品种。
3.根据权利要求3中所述的一种利用SSR分子标记引物鉴别青脆李品种的方法,其特征在于:所述步骤4)中青脆李品种包括田坎麻李、大白李、羌脆李和巴山脆李。
4.根据权利要求3中所述的一种利用SSR分子标记引物鉴别青脆李品种的方法,其特征在于:所述一次PCR扩增采用的是15μL的PCR反应体系,包括10μmol/L的含接头的上游引物、含接头的下游引物各1μL,7.5μL酶mix,1μLDNA模板以及4.5μLddH2O。
5.根据权利要求3中所述的一种利用SSR分子标记引物鉴别青脆李品种的方法,其特征在于:所述一次PCR扩增采用的程序为:94℃预变性5min;94℃变性30S,60℃退火30S,72℃延伸30S,共30个循环;最后72℃延伸5min;延伸后于4℃保存PCR扩增产物。
6.根据权利要求3中所述的一种利用SSR分子标记引物鉴别青脆李品种的方法,其特征在于:所述步骤3)中,带荧光的SSR分子标记引物对的荧光染色基团为HEX或FAM。
7.一种权利要求1所述的SSR分子标记引物在青脆李品种的遗传多样性检测、遗传种质鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位与标记辅助育种中的应用。
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