[发明专利]LncRNA ANRIL在儿童急性淋巴细胞白血病中的临床应用在审
申请号: | 202110773922.6 | 申请日: | 2021-07-08 |
公开(公告)号: | CN113549679A | 公开(公告)日: | 2021-10-26 |
发明(设计)人: | 王晓卫;李萌;曹娜;任晓艳;王雅茹;孙文杰;王星 | 申请(专利权)人: | 南京市儿童医院 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/6886;C12N15/113;C12N15/87;C12Q1/02 |
代理公司: | 重庆市信立达专利代理事务所(普通合伙) 50230 | 代理人: | 刘洁 |
地址: | 210008 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | lncrna anril 儿童 急性 淋巴细胞 白血病 中的 临床 应用 | ||
1.一种调控基因的表达体,其特征在于,所述调控基因的表达体为LncRNA ANRIL。
2.一种由权利要求1所述的调控基因的表达体的确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法,其特征在于,所述确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法包括以下步骤:
步骤一,进行RNA提取及qRT-PCR;
步骤二,进行细胞培养;
步骤三,进行RNAi实验;
步骤四,进行细胞增殖及凋亡测定;
步骤五,进行统计学分析。
3.如权利要求2所述的确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法,其特征在于,步骤一中,所述RNA提取及qRT-PCR,包括:
(1)使用Trizol试剂提取细胞中的总RNA,对提取的总RNA使用Nanodrop检测仪进行RNA浓度检测和纯度鉴定;
(2)利用反转录试剂盒反转总RNA成单链cDNA,利用PCR扩增仪进行cDNA扩增,根据GeneBank数据库中序列设计引物;
(3)使用SYBR Green染料法于StepOnePlusTMReal-Time PCR Systems定量PCR仪检测基因的表达,采用方法计算基因表达的相对比值,其中GAPDH为内参基因,每个样本至少重复3次。
4.如权利要求3所述的确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法,其特征在于,所述引物ANRIL的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,引物KLF2的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示,引物p21的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,引物INK4B的核苷酸序列如SEQ IDNO:4所示。
5.如权利要求2所述的确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法,其特征在于,步骤二中,所述细胞培养,包括:
在5%CO2的37℃的潮湿培养箱中,采用含有10%胎牛血清、1μg/mL嘌呤霉素的RPMI-1640培养基培养细胞,每隔2天更换培养液。
6.如权利要求2所述的确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法,其特征在于,步骤三中,所述RNAi实验,包括:
(1)根据ANRIL的核苷酸序列设计靶向ANRIL的特异siRNA,包括Si-ANRIL-1和Si-ANRIL-2,同时设计一组scrambled nucleotide序列作为阴性对照,细胞系在相应培养基中培养;
(2)使用将siRNA转染至细胞内;
(3)Amaxa Nucleofector细胞核转染系统综合应用电穿孔技术及细胞特异性细胞核转染液,直接把外源基因导入原代细胞及细胞系的细胞浆及细胞核中;
(4)转染完成后,细胞继续培养48h,测定转染效率后收集细胞用于后续qRT-PCR实验。
7.如权利要求6所述的确定LncRNA ANRIL在ALL细胞系中的表达模式的方法,其特征在于,所述Si-ANRIL-1的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,所述Si-ANRIL-2的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
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