[发明专利]与白菜紫色性状相关的InDel分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子标记辅助育种技术领域，具体涉及与白菜紫色性状相关的InDel分子标记及其应用。本发明提供与白菜紫色性状相关的InDel分子标记，所述InDel分子标记的多态性为缺失/插入序列，通过序列如SEQ ID NO.2‑3所示的特异性引物扩增得到。该分子标记可用于区分鉴定紫色白菜和绿色白菜，具有较高的准确性，可作为紫色白菜育种的分子标记辅助选择工具，在实际生产中具有重要意义。

技术领域

本发明涉及分子标记辅助育种技术领域，具体涉及与白菜紫色性状相关的InDel分子标记及其应用。

背景技术

白菜是十字花科、芸薹属的草本植物。大白菜(Brassica rapaL.ssp.pekinensis)为白菜的一种，是原产于中国的一种蔬菜作物，在中国的芸薹属蔬菜作物当中种类多，种植面积广，在生产中占据十分重要的经济地位。紫色大白菜和绿色大白菜是白菜的两种不同表型颜色，紫色大白菜表现为叶片上、下表皮均为紫色，内叶至外叶均为紫色，绿色大白菜则整株为绿色，其表型差异主要由花青素含量不同所致。

花青素苷属类黄酮类物质，为构成植物颜色的重要水溶性色素之一，常见花青素有6种，包括矢车菊花青素苷(Cyanidin)、天竺葵花青素苷(Pelargonidin)、芍药花青素苷(Peonidin)、锦葵花青素苷(Malvidin)、矮牵牛花青素苷(Petunidin)、飞燕草色素(Delpinidin)。花青素不仅使紫色大白菜叶色鲜亮，还具有保健功能，有研究表明其强大的抗氧化能力能帮助人类预防癌症、心脑血管等疾病。近年来育种学家对紫色基因进行遗传性状、花青素成分测定、基因定位及相关基因的表达进行了研究，探索花青素表达模式及决定基因。

随分子生物学技术逐渐发展，人们对白菜类蔬菜叶色相关基因做了许多研究，研究叶色决定基因及其定位，并分析其调控机理。对叶色决定基因进行定位研究，发现不同叶色决定基因分别定位于A02、A03、A07、A09染色体，于不同材料中，对白菜叶色调控起一定作用的基因位于不同染色体，表明白菜叶色调控过程相对复杂。调控花青素代谢途径的转录调控蛋白主要有三类，R2R2-MYB、bHLH及WDR，其中R2R2-MYB、bHLH属于转录调控因子，WDR参与调控过程，三者组成MBW三元复合体。与白菜叶色相关基因调控过程相对复杂，开发大白菜叶色相关基因的分子标记对研究白菜紫色基因和紫色性状具有一定意义，并能够作为一种分子标记辅助育种手段。

发明内容

本发明的目的是提供一种与白菜紫色性状相关的InDel分子标记，本发明的另一目的是提供该分子标记的应用。

第一方面，本发明提供与白菜紫色性状相关的InDel分子标记，所述InDel分子标记的多态性为缺失/插入序列，所述分子标记通过序列如SEQ ID NO.2-3所示的特异性引物扩增得到。

正向引物：5’-ATGGATGATCTGTCGTATAGGTT-3’(SEQ ID NO.2)；

反向引物：5’-CTAATCAAGCTCCCCAGTCTCTTC-3’(SEQ ID NO.3)。

优选地，所述插入序列的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。如SEQ ID NO.1所示的序列为紫色白菜A02染色体的叶色相关基因特有序列，与白菜的紫色基因紧密连锁。

以上所示的正向引物和反向引物涵盖的待扩增区域为本发明所述的紫色白菜A02染色体的叶色相关基因特有序列的全部序列。

第二方面，本发明提供用于检测所述InDel分子标记的特异性引物对，其序列如SEQ ID NO.2-3所示。

第三方面，本发明提供含有所述特异性引物对的试剂盒。

优选地，所述试剂盒还包括用于PCR扩增的其他试剂，包括但不限于PCR反应缓冲液、DNA聚合酶、dNTP、ddH₂O等。