[发明专利]急性淋巴细胞白血病DNA甲基化标志物及其应用

说明书

本发明涉及一种急性淋巴性白血病DNA甲基化标志物及其应用，其包括基因：ARHGEF3，ATP7B，C14orf102，CoL2A1，LCP2，MAD1L1，MAPK1，LOC100134868，HTR7，BANP，LDLRAD4，NCAM2，PALM2‑AKAP2，RRBP1和SPPL2B，以及和PFKP，PRDM8，PRDM16或其组合，上述基因的DNA片段单独或组合使用，能够用于检测、诊断、分类或预测、治疗监测、预后或其它评价急性淋巴细胞白血病。而且，发明人还进一步地在这18个基因中找到更具代表性的与急性淋巴细胞白血病相关的24个DNA片段，其甲基化程度与急性淋巴细胞白血病确诊、缓解和复发高度相关，发现以上基因组片段或其组合都能够作为ALL诊断标记物，并可有效区分ALL缓解和复发患者，预示其可进一步地作为ALL患者治疗后微小残留病监测的筛查标记物。

技术领域

本发明涉及生物医药领域，特别是涉及一种急性淋巴细胞白血病DNA甲基化标志物及 其应用。

背景技术

急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia，ALL)是淋巴母细胞异常增生引起 的恶性克隆性肿瘤，是最常见的发生于儿童的癌症，占儿童全部癌症的26％，占儿童急性白 血病的75％-80％，其中B细胞急性淋巴细胞白血病在儿童所有ALL中占80％，是最为常见 的ALL类型。成人ALL患者的发病率较低，约占成人急性白血病的20％。

正常情况下，骨髓生成的血液干细胞，也叫免疫细胞，将会分化为成熟血细胞。血液干 细胞可转化为髓质干细胞和淋巴干细胞两种。其中髓质干细胞将分化为三种成熟血细胞，包 括载氧和其他底物到身体不同器官组织的红细胞；起凝血作用的血小板和抗外源感染和疾病 的粒细胞(白细胞)。髓质干细胞异常是急性髓性白血病(AML)的主要发病原因；淋巴干 细胞首先分化为淋巴母细胞，进而分化为机体生产抗体，抵御外援感染的B淋巴细胞和协助 B淋巴细胞产生抗体的T淋巴细胞，以及攻击肿瘤细胞和病毒的自然杀伤细胞。ALL白血病 患者大量干细胞转为淋巴母细胞、B淋巴细胞或T淋巴细胞，又称为白血病细胞，他们不能 有效的防御外源感染，导致血液和骨髓中白细胞，红细胞和血小板细胞数量降低，引发感染、 贫血或出血。对于绝大多数肿瘤，越早发现对于其后续的临床治疗越发简单，患者收益越高。 然而，到目前为止，世界上没有特殊的应用于急性淋巴性白血病的早期检测技术方法，白血 病常规检测为骨髓或血液样本显微镜检，通过白细胞等的大小、形状和其他特征对其进行鉴 定和分类，最主要的指标是血细胞是否成熟。ALL的确诊通常需要骨髓中至少20％的细胞为 幼稚细胞，正常情况下，幼稚细胞不超过骨髓细胞的5％。

另一方面，对于复发难治性白血病患者，存在治疗监测难和预后难等问题，复发治疗极 易产生药物抗性，治疗效果逐渐降低。患者用药缓解后微小残留病变(minimalresidual disease， MRD)的检测已成为不同肿瘤临床治疗检测研究热点。白血病患者在经过治疗达到完全缓解 (CR)后，虽然用常规的形态学方法(放大100倍显微镜观察骨髓)不能检测到的明显的白 血病细胞，但体内可能仍然存留少量白血病残留细胞。即使用流式细胞学方法来检测，灵敏 度可以达到10^-4-10^-5(也就是1万～10万个细胞中可发现1个白血病细胞)，然而却无法检测 到更早期的出现细胞形态变化前的细胞。应用分子诊断学方法可以发现更早期的具有基因变 异或基因表达差异的白血病细胞，目前临床检测的分子标志物主要集中在细胞遗传学异常， 如融合基因和点突变等。但是携带此类细胞遗传学异常和突变异常的患者仅仅占患病人群的 一部分。鉴于白血病的复杂性，寻找可用于精确诊断和预后分层的分子标志物具有重要意义。