[发明专利]与非小细胞肺癌预后相关的标志分子在审

专利信息
申请号: 202110502193.0 申请日: 2021-05-08
公开(公告)号: CN113373220A 公开(公告)日: 2021-09-10
发明(设计)人: 王艳;黄蔚;余和芬;张竞尧 申请(专利权)人: 首都医科大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;G01N33/574;G01N33/573;G01N33/68;G06Q10/06
代理公司: 北京睿阳联合知识产权代理有限公司 11758 代理人: 郭奥博;张颖
地址: 100069 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 细胞 肺癌 预后 相关 标志 分子
【说明书】:

发明涉及与非小细胞肺癌预后相关的标志分子,所述标志分子包括如SEQ ID NO:1、SEQ IDNO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4以及SEQ ID NO:5所示的至少一个基因序列。本发明提供的标志分子能够较好地反映非小细胞肺癌患者的预后,为非小细胞肺癌患者的诊断和预后提供了新策略。

技术领域

本发明涉及癌症治疗以及预后评价领域,具体涉及与非小细胞肺癌预后相关的标志分子。

背景技术

肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(Non-Small Cell LungCancer,NSCLC)约占肺癌病例的85%。随着近年来生物信息技术的不断发展,以及测序水平的不断提高,利用已有的国内外数据库进行深入挖掘,寻找非小细胞肺癌的潜在诊断、预后以及药物靶点尤为重要。

真核细胞的转录起始是一个复杂的过程,其中发挥重要调控功能的转录因子与多种人类肿瘤的发生有关。在许多类型的癌症中,转录因子的活性通过各种直接机制改变,包括染色体易位、基因扩增或缺失、点突变和表达改变,以及通过影响转录因子结合的非编码DNA突变来间接改变。转录因子在肿瘤中起着关键作用,如影响细胞周期、免疫应答、免疫细胞浸润等。同时,转录因子可以是癌基因或抑癌基因的产物,例如EMT诱导的转录因子在创建促肿瘤环境中的作用。近年来,转录因子在肿瘤的研究备受关注,但其在肿瘤预后中的发挥的作用尚不完全明确,最近已有部分研究表明部分转录因子具有预测恶性肿瘤患者预后的功能,最近已有文章通过分析公共数据库的神经胶质瘤数据,找到了具有预测功能的关键靶基因和转录因子包括PHLDB1、ZBTB16等;Cheng Q等利用通过使用公共数据库的数据挖掘来识别胶质母细胞瘤中差异表达的转录因子,发现LHX2、MEOX2、SNAI2、ZNF22四因素联合评分模型能预测胶质母细胞瘤患者的预后。通过对公共数据的分析确定了三个协同主因子(ETS2、HNF4a和Jun B),ETS2、HNF4a和Jun B与超级增强子有关,使用BRD4抑制剂能够消除TGF-β诱导的上皮内皮细胞转化,这些调节因子可以调节部分EMT状态的转换同时其过度表达预示着不良的临床结果。

加权相关网络分析(WGCNA)可以用来寻找高度相关的基因簇(模块),WGCNA可以评估模块中基因之间的相互联系,将基因表达谱数据转化为共表达模块,从而构建基因调控网络。WGCNA分为5个步骤,构建基因共表达网络,识别模块,关联模块,关联模块与外部信息,研究模块关系,找出感兴趣模块中的关键驱动因素。WGCNA在胰腺癌、肺癌、肺癌等肿瘤研究中有着广泛的应用和强大的作用。

目前的研究多基于调控NSCLC发生和发展的转录因子的调控机制研究,对于其作为预后靶标的研究相对较少,且尚未有较为准确的能够预测NSCLC患者预后的标志分子。

发明内容

本发明的目的是筛选与非小细胞肺癌预后高度相关的标志分子,为非小细胞肺癌患者的预防和治疗提供新的策略。

本发明的第一目的在于提供分离的与非小细胞肺癌预后相关的标志分子,包括:如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4以及SEQ ID NO:5所示的至少一个基因序列。

具体而言,本发明提供的与非小细胞肺癌预后相关的标志分子可以是SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5中的任意一个序列,也可以包括其中的任意两个、三个、四个或者全部五个序列。

其中,如SEQ ID NO:1所示的基因序列(其编码的蛋白又名ETV1),有研究表明当EGFR通路受损时,转录抑制因子CIC调控的癌基因Ets因子ETV1可以被激活,从而促进NSCLC细胞的生长,进而导致吉非替尼耐药。目前,尚未见该基因序列或相应的蛋白与非小细胞肺癌预后相关的报道。

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