[发明专利]一种检测HIV基因组拷贝数的方法在审
| 申请号: | 202110189319.3 | 申请日: | 2021-02-19 |
| 公开(公告)号: | CN114958980A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
| 发明(设计)人: | 黄维金;王佑春;赵晨燕;周泽华;张新禹 | 申请(专利权)人: | 中国食品药品检定研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 崔锡强 |
| 地址: | 102629*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 hiv 基因组 拷贝 方法 | ||
1.一种检测待测样品中HIV基因组拷贝数的方法:
(a)提供含有单拷贝HIV基因组的细胞以及待测样品,提取所述细胞中的核酸以及待测样品中的核酸,将所述细胞中的核酸称为第一核酸,将所述待测样品中的核酸称为第二核酸;
(b)通过数字PCR检测第一核酸和第二核酸的拷贝数;
(c)对所述细胞进行计数;
(d)计算细胞计数的数值与第一核酸的拷贝数的数值的比值;当所述比值处于0.7至1.3的范围内时,获得的第二核酸的拷贝数即为HIV的拷贝数。
2.一种数字PCR检测结果的评价方法:
(a)提供含有单拷贝靶核酸的细胞以及待测样品,提取所述细胞中的靶核酸以及待测样品中的靶核酸,将所述细胞中的靶核酸称为第一核酸,将所述待测样品中的靶核酸称为第二核酸;
(b)通过数字PCR检测第一核酸和第二核酸的拷贝数;
(c)对所述细胞进行计数;
(d)计算细胞计数的数值与第一核酸的拷贝数的数值的比值;当所述比值处于0.7至1.3的范围内时,表明该数字PCR检测结果准确,获得的第二核酸的拷贝数即为靶核酸的拷贝数。
3.权利要求1或2的方法,其中,所述方法具有选自下列的一个或多个特征:
(1)所述细胞选自8E5,J-lat6.3,J-lat8.4,J-lat9.2,J-lat15.4,J-lat5A8中的任意一种或几种;优选地,所述细胞为8E5细胞;
(2)待测样品选自细胞(例如,离体的体细胞或体细胞群,分离的血细胞或血细胞群),血浆,血清,全血中的一种或多种;
(3)所述待测样品获自哺乳动物(例如,人);
(4)第一核酸包括DNA和/或RNA;
(5)第二核酸包括DNA和/或RNA;
(6)当所述比值处于0.8至1.2的范围内时,获得的第二核酸的拷贝数即为待测样品的拷贝数;优选地,当所述比值处于0.9至1.1的范围内时,获得的第二核酸的拷贝数即为待测样品的拷贝数;
(7)所述数字PCR选自微滴式数字PCR或芯片式数字PCR;
(8)所述HIV为HIV-1和/或HIV-2。
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