[发明专利]核酸序列浓度的确定

权利要求书

1.一种确定未片段化核酸中被测序列的浓度的方法，所述方法包括以下步骤：

i.确定包含片段化核酸的样品中核酸的长度分布(LD)，其中所述片段化核酸来源于所述未片段化核酸；

ii.用测量方法测量所述包含片段化核酸的样品中所述被测序列的浓度；和

iii.用校正系数校正所述包含片段化核酸的样品中所述被测序列的测量浓度，以获得未片段化核酸中所述被测序列的浓度，其中所述校正系数基于所述长度分布(LD)和所述测量方法的至少一个参数。

2.根据权利要求1所述的方法，其中测量所述被测序列的浓度包括扩增包含所述被测序列的要扩增的序列，并且所述测量方法的至少一个参数包括要扩增的序列的长度(L_a)。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述校正系数由以下确定：

其中L是所述要扩增的序列的长度(L_a)；

其中f(i)是所述样品中片段长度为i个碱基对的概率；和

其中是核酸片段的平均长度。

4.根据权利要求2所述的方法，其中如果所述样品中至少5％的核酸的长度比要扩增的序列的长度短，则应用所述校正。

5.根据权利要求2所述的方法，其中所述要扩增的序列的长度大于40bp且小于200bp。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述样品中核酸片段的长度分布(LD)包含在25bp至350bp的范围内。

7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法不包括获得或预测所述片段化核酸的遗传坐标。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量方法是等温定量核酸扩增方法。

9.根据权利要求1所述的方法，其中所述测量方法是非等温定量核酸扩增方法。

10.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法进一步包括：

i.用测量方法测量所述包含片段化核酸的样品中第二被测序列的浓度，其中测量所述第二被测序列的浓度包括扩增包含所述第二被测序列的要扩增的第二序列；和

ii.用校正系数校正所述片段化核酸中所述第二被测序列的测量浓度，以获得所述未片段化核酸中所述第二被测序列的浓度，其中所述校正系数基于所述长度分布(LD)和所述测量方法的至少一个参数；

其中要扩增的第一序列的长度不同于要扩增的第二序列的长度。

11.根据权利要求10所述的方法，其中所述测量方法包括多重扩增步骤。

12.一种被配置为确定未片段化核酸中被测序列的浓度的系统，所述系统包括：

i.被配置为测量包含片段化核酸的样品中所述被测序列的浓度的扩增模块，所述片段化核酸来源于所述未片段化核酸；

ii.被配置为根据所述样品中核酸的长度分布(LD)和所述测量的至少一个参数来计算校正系数的模块；和

iii.被配置为用所述校正系数计算未片段化核酸中所述被测序列的浓度的模块。

13.根据权利要求12所述的被配置为确定未片段化核酸中被测序列的浓度的系统，其中被配置为测量所述片段化核酸中所述被测序列的浓度的模块是等温定量核酸扩增模块，其选自环介导的等温扩增模块和基于定量核酸序列的扩增模块。

14.根据权利要求12所述的被配置为确定未片段化核酸中被测序列的浓度的系统，其中被配置为测量所述片段化核酸中所述被测序列的浓度的模块是非等温定量核酸扩增模块，其选自定量聚合酶链式反应模块、实时聚合酶链式反应模块、数字聚合酶链式反应模块、多重聚合酶链式反应模块和多重数字聚合酶链式反应模块。

15.根据权利要求12所述的被配置为确定未片段化核酸中被测序列的浓度的系统，其中所述测量的参数包括要扩增的序列的长度。