[发明专利]靶向RNA的敲低和替代组合物及使用方法

权利要求书

1.一种组合物，所述组合物包含编码靶RNA敲低和替代治疗剂的核酸序列，所述治疗剂包含(a)RNA结合多肽或其部分；和(b)治疗性蛋白，其中所述RNA结合多肽结合并切割靶RNA或由所述靶RNA编码的蛋白质，其中编码具有一个或多个功能获得或丧失型突变的致病性蛋白的致病性RNA包含所述靶RNA，并且其中所述治疗性蛋白是所述致病性蛋白的替代蛋白。

2.一种组合物，所述组合物包含编码靶RNA敲低和替代治疗剂的核酸序列，所述治疗剂包含(a)RNA结合多肽或其部分；和(b)治疗性蛋白，其中所述RNA结合多肽结合并切割靶视紫红质RNA或由所述靶视紫红质RNA编码的蛋白质，其中编码具有一个或多个功能获得或丧失型视紫红质突变的致病性视紫红质蛋白的致病性视紫红质RNA包含所述靶视紫红质RNA，并且其中所述治疗性蛋白是野生型视紫红质蛋白。

3.如权利要求1所述的组合物，其中所述治疗性蛋白选自由以下组成的组：视紫红质(色素性视网膜炎)、PRPF3(色素性视网膜炎)、PRPF31(常染色体显性色素性视网膜炎)、GRN(FTD)、SOD1(ALS)、PMP22(夏科-马里-图思病)、PABPN1(眼咽型肌营养不良)、KCNQ4(听力损失)、CLRN1(乌谢尔综合征)、APOE2(阿尔茨海默氏病)、APOE4(阿尔茨海默氏病)、BEST1(眼病)、MYBPC3(家族性心肌病)、TNNT2(家族性心肌病)和TNNI3(家族性心肌病)。

4.如权利要求2或3所述的组合物，其中所述治疗性蛋白是视紫红质。

5.如权利要求3或4所述的组合物，其中视紫红质是人视紫红质。

6.如权利要求4所述的组合物，其中所述治疗性视紫红质是“硬化的”视紫红质。

7.如权利要求1或2所述的组合物，其中所述RNA结合蛋白包含Pumilio和FBF(PUF)蛋白。

8.如权利要求1或2所述的组合物，其中所述RNA结合蛋白包含基于Pumilio的组装体(PUMBY)蛋白。

9.如权利要求2所述的组合物，其中所述视紫红质靶RNA序列包含CAACGAGTCTTTTGTCATCTACATGT(SEQ ID NO:462)、CGCCAGCGTGGCATTCTACATCTTCA(SEQ IDNO:463)或CATCTATATCATGATGAACAAGCAGT(SEQ ID NO:464)。

10.如权利要求9所述的组合物，其中所述视紫红质靶RNA编码在位置268至277处包含YASVAFYIFT(SEQ ID NO:486)的氨基酸。

11.如权利要求5所述的组合物，其中所述“硬化的”视紫红质由不包含所述视紫红质靶RNA的核酸序列编码，所述视紫红质靶RNA包含GCCAGCGTGGCATTCTACATCTTC(SEQ ID NO:406)。

12.如权利要求11所述的组合物，其中所述“硬化的”视紫红质由包含GCTTCCGTAGCTTTTTATATTTTT(SEQ ID NO:408)的核酸序列编码。

13.如权利要求1或2所述的组合物，其中所述核酸序列包含至少一个启动子。

14.如权利要求8所述的组合物，其中所述至少一个启动子是组成型启动子或组织特异性启动子。

15.如权利要求9所述的组合物，其中所述至少一个启动子选自由以下组成的组：视蛋白启动子、EFS启动子和两者。

16.如权利要求1或2所述的组合物，其中所述核酸序列包含两个启动子。