[发明专利]用于确定禽群中禽病原性大肠杆菌(APEC)感染的风险的方法在审
| 申请号: | 202080051592.3 | 申请日: | 2020-07-06 |
| 公开(公告)号: | CN114174539A | 公开(公告)日: | 2022-03-11 |
| 发明(设计)人: | M·达尔加茨;F·蒂曼;M·魏斯曼;S·佩尔策;M·弗吕格尔;F·伯尔;A·卡普佩尔;E·I·伊格威;A·瑞斯 | 申请(专利权)人: | 赢创运营有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/19 |
| 代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 张小勇 |
| 地址: | 德国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 确定 禽群中禽病 原性 大肠杆菌 apec 感染 风险 方法 | ||
1.用于确定禽群中禽病原性大肠杆菌(APEC)感染的风险的方法,所述方法包括
确定源自禽群的合并样品中特定毒力因子(VF)的量各自相对于大肠杆菌参考基因ybbW(SEQ ID NO:6)或其功能片段的量的数量比,
其中所述特定毒力因子至少包括基因iroN(SEQ ID NO.:1)和ompT(SEQ ID NO:2)或其功能片段。
2.根据权利要求1-2所述的方法,其中所述特定毒力因子还包括选自hlyF(SEQ ID NO:3)、iss(SEQ ID NO:4)、iutA(SEQ ID NO:5)或其功能片段的至少一种基因。
3.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中源自禽群的合并样品是收集在容纳所述禽群的禽舍中的环境样品。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述环境样品选自排泄物材料、垫料材料、空气粉尘材料或它们的组合。
5.根据权利要求3或4中任一项所述的方法,其中所述环境样品是排泄物材料。
6.根据权利要求5所述的方法,其中排泄物样品材料是粪便材料。
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述粪便材料是随机收集的个体粪便样品的复合样品。
8.根据前述权利要求中任一项所述的方法,其中通过qPCR检测和定量大肠杆菌参考基因和APEC毒力因子。
9.一种环境筛查试剂盒,其包含用于检测和定量至少iroN(SEQ ID NO.:1)、ompT(SEQID NO:2)和ybbW(SEQ ID NO:6)的引物和任选地探针。
10.根据权利要求9所述的环境筛查试剂盒,进一步包含用于检测和定量选自hlyF(SEQID NO:3)、iss(SEQ ID NO:4)、iutA(SEQ ID NO:5)的至少一种基因的引物和任选地探针。
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