[发明专利]乙型肝炎病毒pgRNA芯片数字PCR绝对定量检测试剂盒及方法在审
申请号: | 202011643733.9 | 申请日: | 2020-12-31 |
公开(公告)号: | CN112795696A | 公开(公告)日: | 2021-05-14 |
发明(设计)人: | 李世学;王怀远;董大光;王志富;刘明坤;叶锋 | 申请(专利权)人: | 北京思尔成生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 张如佳 |
地址: | 100176 北京市大兴区经济技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 乙型肝炎 病毒 pgrna 芯片 数字 pcr 绝对 定量 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种引物探针组合物在制备利用数字PCR检测乙型肝炎病毒pgRNA的试剂或试剂盒中的应用;
所述引物探针组合物由引物HBV-F、引物HBV-R和探针HBV-P组成;
所述引物HBV-F为如下(a1)或(a2):
(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;
(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;
所述引物HBV-R为如下(a3)或(a4):
(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;
(a4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;
所述探针HBV-P,一个末端具有荧光报告基团,另一个末端具有荧光淬灭基团,其核苷酸序列如下(a5)或(a6):
(a5)如序列表的序列3所示;
(a6)如将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加所示。
2.一种引物探针组合物,由引物HBV-F、引物HBV-R和探针HBV-P组成;
所述引物HBV-F为如下(a1)或(a2):
(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子;
(a2)将序列1经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列1具有相同功能的DNA分子;
所述引物HBV-R为如下(a3)或(a4):
(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子;
(a4)将序列2经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列2具有相同功能的DNA分子;
所述探针HBV-P,一个末端具有荧光报告基团,另一个末端具有荧光淬灭基团,其核苷酸序列为如下(a5)或(a6):
(a5)如序列表的序列3所示;
(a6)如将序列3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加所示。
3.权利要求2所述引物探针组合物的应用,为如下(b1)、(b2)、(b3)、(b4)、(b5)或(b6)或(b7)或(b8):
(b1)鉴定乙型肝炎病毒;
(b2)制备用于鉴定乙型肝炎病毒的试剂盒;
(b3)检测待测样本是否含有乙型肝炎病毒pgRNA;
(b4)制备用于检测待测样本是否含有乙型肝炎病毒pgRNA的试剂盒;
(b5)检测待测样本中乙型肝炎病毒pgRNA的载量;
(b6)制备用于检测待测样本中乙型肝炎病毒pgRNA载量的试剂盒;
(7b)预测乙肝复发率;
(8b)制备用于预测乙肝复发率的产品。
4.一种试剂盒,包括权利要求2所述引物探针组合物;所述试剂盒的功能为如下(c1)或(c2)或(c3)或(c4):
(c1)鉴定乙型肝炎病毒;
(c2)检测待测样本是否含有乙型肝炎病毒pgRNA;
(c3)检测待测样本中乙型肝炎病毒pgRNA的载量;
(c4)预测乙肝复发率。
5.一种检测待测样本是否含有乙型肝炎病毒pgRNA的方法,包括如下步骤:以待测样本的cDNA为模板,采用权利要求2所述引物探针组合物进行数字PCR;如果检测结果为阳性,所述待测样本含有乙型肝炎病毒pgRNA;如果检测结果为阴性,所述待测样本不含有乙型肝炎病毒pgRNA。
6.一种检测待测样本中乙型肝炎病毒pgRNA的载量的方法,包括如下步骤:以待测样本的cDNA为模板,采用权利要求2所述引物探针组合物进行数字PCR;根据乙型肝炎病毒pgRNA阳性荧光点得到待测样本中乙型肝炎病毒pgRNA的载量。
7.一种用于通过数字PCR检测乙型肝炎病毒pgRNA的预混液,其中含有权利要求2所述引物探针组合物中所述的引物HBV-F、引物HBV-R、探针HBV-P和QuantStudioTM3D DigitalPCR Master Mix;所述预混液中,引物HBV-F的浓度为0.53μM,引物HBV-R的浓度为0.53μM,探针HBV-P的浓度为1.05μM。
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