[发明专利]水稻稻瘟病抗性基因Pita的SNP分子标记的开发和应用

权利要求书

1.一种水稻稻瘟病抗性基因Pita的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP分子标记为K_120501，其中K_120501的多态性为G或C。

2.如权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP分子标记K_120501的多态性位点位于chr12.10611406。

3.一种用于检测如权利要求1所述的SNP分子标记K_120501的引物组，其特征在于：所述引物组包括特异性引物和通用引物，其中，所述特异性引物包括Primer Seq Allele X和Primer Seq Allele Y，所述Primer Seq Allele X的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述Primer Seq Allele Y的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

4.如权利要求3所述引物组在水稻育种中的应用。

5.一种如权利要求1所述的SNP分子标记的检测方法，其特征在于：所述检测方法包括以下步骤：

S1、从水稻叶片中提取基因组DNA；

S2、以步骤S1中提取的基因组DNA为模板，利用SNP分子标记K_120501的引物，对K_120501分子标记进行检测；

S3、若K_120501的SNP位点碱基为G，判定测试的水稻样品为纯合的抗病Pita基因型；若检测位点碱基为C，判定测试的水稻样品为纯合的不抗病的Pita基因型；若检测位点同时检测到G、C，判断待测水稻为杂合的抗病Pita基因型。

6.如权利要求5所述的检测方法，其特征在于：步骤S2中，用KASP技术对SNP位点进行检测。

7.如权利要求1或2任一所述SNP分子标记在水稻育种中的应用。

8.如权利要求7所述的SNP分子标记的应用，其特征在于：所述应用为利用K_120501分子标记进行检测，选择携带Pita基因的水稻品系进行后续育种。

9.一种试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1-3所示的引物。

10.一种基因芯片，其特征在于：所述基因芯片包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1-3所示的引物。