[发明专利]检测EGFR基因突变的核酸组合物及试剂盒和EGFR基因突变的检测方法在审
| 申请号: | 202011168443.3 | 申请日: | 2020-10-28 |
| 公开(公告)号: | CN112322733A | 公开(公告)日: | 2021-02-05 |
| 发明(设计)人: | 张炳为;辜嘉;周树民 | 申请(专利权)人: | 苏州中科先进技术研究院有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司: | 深圳市科进知识产权代理事务所(普通合伙) 44316 | 代理人: | 魏毅宏 |
| 地址: | 215123 江苏省苏州*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 检测 egfr 基因突变 核酸 组合 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测EGFR基因突变的核酸组合物,其特征在于,包括:
序列如SEQ ID No.1及SEQ ID No.2所示的第一引物对和序列如SEQ ID No.3所示的第一探针,所述第一引物对和所述第一探针用于检测EGFR基因的18号外显子的G719A突变、G719S突变及G719C突变中的至少一种;及
序列如SEQ ID No.4及SEQ ID No.5所示的第二引物对和序列如SEQ ID No.6所示的第二探针,所述第二引物对和所述第二探针用于检测EGFR基因的20号外显子的D770_N771insG突变;
其中,所述第一探针的两端分别连接有第一荧光报告基团和第一荧光淬灭基团,所述第二探针的两端分别连接有第二荧光报告基团和第二荧光淬灭基团,所述第一荧光报告基团与所述第二荧光报告基团不同。
2.一种检测EGFR基因突变的核酸组合物,其特征在于,包括:
序列如SEQ ID No.7及SEQ ID No.8所示的第三引物对和序列如SEQ ID No.9所示的第三探针,所述第三引物对和所述第三探针用于检测EGFR基因的19号外显子的缺失突变,所述EGFR基因的19号外显子的缺失突变包括:E746_A750del(1)突变、E746_T751I突变、E746_T751del突变、E746_T751A突变、E746_S752A突变、E746_S752V突变、E746_A750del(2)突变、E746_S752D突变、L747_A750P突变、L747_T751Q突变、L747_E749del突变、L747_T751del突变、L747_S752del突变、L747_A750P突变、L747_P753Q突变、L747_T751S突变、L747_P753S突变、L747_T751del突变及L747_T751P突变中的至少一种。
3.一种检测EGFR基因突变的核酸组合物,其特征在于,包括:
序列如SEQ ID No.13及SEQ ID No.14所示的第五引物对和序列如SEQ ID No.15所示的第五探针,所述第五引物对和所述第五探针用于检测EGFR基因的20号外显子的S768I突变。
4.一种检测EGFR基因突变的核酸组合物,其特征在于,包括:
序列如SEQ ID No.10及SEQ ID No.11所示的第四引物对和序列如SEQ ID No.12所示的第四探针,所述第四引物对和所述第四探针用于检测EGFR基因的20号外显子的T790M突变;
及/或,序列如SEQ ID No.16及SEQ ID No.17所示的第六引物对和序列如SEQ IDNo.18所示的第六探针,所述第六引物对和所述第六探针用于检测EGFR基因的20号外显子的H773_V774insH突变;
及/或,序列如SEQ ID No.19及SEQ ID No.20所示的第七引物对和序列如SEQ IDNo.21所示的第七探针,所述第七引物对和所述第七探针用于检测EGFR基因的21号外显子的L861Q突变;
及/或,序列如SEQ ID No.22及SEQ ID No.23所示的第八引物对和序列如SEQ IDNo.24所示的第八探针,所述第八引物对和所述第八探针用于检测EGFR基因的20号外显子的V769_D770insASV突变;
及/或,序列如SEQ ID No.25及SEQ ID No.26所示的第九引物对和序列如SEQ IDNo.27所示的第九探针,所述第九引物对和所述第九探针用于检测EGFR基因的21号外显子的L858R突变。
5.根据权利要求4所述的检测EGFR基因突变的核酸组合物,其特征在于,还包括:用于检测内控基因的第十引物对和第十探针;
进一步地,所述内控基因为CFTR基因,所述第十引物对的序列如SEQ ID No.28及SEQID No.29所示,所述第十探针的序列如SEQ ID No.30。
6.一种检测EGFR基因突变的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1~5任一项所述的检测EGFR基因突变的核酸组合物。
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