[发明专利]一种定量检测转基因大豆ZH10-6的特异性引物及方法在审

专利信息
申请号: 202010972528.0 申请日: 2020-09-16
公开(公告)号: CN111876522A 公开(公告)日: 2020-11-03
发明(设计)人: 赵新;王一衡;刘双;尉万聪;兰青阔;王永 申请(专利权)人: 天津市农业科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 天津市杰盈专利代理有限公司 12207 代理人: 朱红星
地址: 300381 天津市西青区*** 国省代码: 天津;12
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摘要:
搜索关键词: 一种 定量 检测 转基因 大豆 zh10 特异性 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种定量检测转基因大豆ZH10-6的特异性引物,其特征在于包括ZH10-6的第二个5’端外源基因插入侧翼的序列如下:

正向引物序列:5’- CAAATCCTATGGGCATTCTTCC -3’

反向引物序列:5’- CTAGAGCAGCTTGAGCTTGGATC-3’

探针序列:FAM-CACCTTCTGGCTCCTTCAAACACTG-BHQ1

内源基因Lectin基因序列:

正向引物序列:5’-GCCCTCTACTCCACCCCCA-3’

反向引物序列:5’-GCCCATCTGCAAGCCTTTTT-3’

探针序列:FAM-AGCTTCGCCGCTTCCTTCAACTTCAC-BHQ1。

2.一种采用权利要求1所述的特异性引物进行快速定量检测方法,其特征在于如下步骤:

(1)实时荧光定量PCR检测方法的特异性引物,其特征在于

正向引物序列:5’-CAAATCCTATGGGCATTCTTCC-3’,

反向引物序列:5’- CTAGAGCAGCTTGAGCTTGGATC-3’,

探针序列:FAM-CACCTTCTGGCTCCTTCAAACACTG-BHQ1;

内源基因Lectin基因序列:

正向引物序列:5’-GCCCTCTACTCCACCCCCA-3’,

反向引物序列:5’-GCCCATCTGCAAGCCTTTTT-3’,

探针序列:FAM-AGCTTCGCCGCTTCCTTCAACTTCAC-BHQ1;

(2)实时荧光定量PCR反应体系:总体积20 μL,包括TaKaRa 2×Premix Ex Taq (probeqPCR) 10 μL,上下游引物(10 µmol/L)各1 μL,探针(10 µmol/L) 0.5 μL,DNA模板(25 ng/μL) 2 μL, 用无菌水补充至20 μL;

(3)实时荧光定量PCR反应扩增程序:95℃预变性10 min, 1个循环;95℃变性10 s, 60℃退火30 s, 40个循环;

(4)构建转基因耐除草剂大豆ZH10-6转化体序列定量检测的标准参照物,提取转基因耐除草剂大豆ZH10-6的基因组DNA后,进行梯度稀释,分别得到100%、20%、4%、0.8%、0.16%、0.032%、0.0064%、0.00128%8个浓度的DNA,利用8个浓度梯度的DNA为模板进行实时荧光PCR扩增,分别构建转基因耐除草剂大豆ZH10-6转化体特异性序列和内源基因Lectin基因的标准曲线;

(5)设定阈值后,荧光定量PCR仪的数据分析软件自动计算每个反应的Ct值和靶标浓度,并记录,按照公式A=B/[B+(C-B)/D]×100%,计算出试样中转基因耐除草剂大豆ZH10-6转化体序列百分含量,式中A为转基因耐除草剂大豆ZH10-6转化体序列百分含量,B为转基因耐除草剂大豆ZH10-6转化体序列的靶标浓度,C为Lectin内源基因的靶标浓度,D为转基因大豆ZH10-6成分中掺入非转基因大豆成分的校正系数,即为转基因大豆ZH10-6基因组大小/掺入非转基因大豆基因组大小。

3.权利要求1所述定量检测转基因大豆ZH10-6的特异性引物在用于ZH10-6快速定量高效筛查方面的应用。

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