[发明专利]一种影响鸡全净膛重的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种影响鸡全净膛重的分子标记及其应用，属于分子标记辅助选择技术及动物遗传育种技术领域。本发明影响鸡全净膛重的分子标记是通过对大围山微型鸡和隐性白洛克肉鸡组建的F2代资源群体741只试验鸡进行全基因组关联(GWAS)分析得到，在鸡参考基因组Gallus_gallus.GRCg6a版本1号染色体上的第100911059bp处有一个TC的核苷酸单碱基突变(命名为：Chr.1100911059TC)，定位在其附近的基因为软骨凝集蛋白（Chondrolectin，CHODL）基因，突变显著影响了鸡的全净膛重。本发明公开了该分子标记的获得及应用。本发明还提供了一种影响鸡全净膛重的分子标记基因分型检测方法，利用该方法可建立高效准确的分子标记辅助育种技术，将其应用于鸡产肉性能遗传改良中，从而提高鸡的产肉量。

技术领域

本发明涉及分子标记辅助选择技术及动物遗传育种技术领域，特别涉及一 种影响鸡全净膛重的分子标记及其应用。

背景技术

随着全球人口持续增长，鸡肉和鸡蛋是除牛奶外单位货币可购买的动物蛋 白克数最高的两类蛋白，在生产成本方面具有较大的竞争力。在中国，鸡肉是 第二大肉类产品，占肉类产量的15％，其比率在逐年升高。2019年，我国猪牛 羊禽肉产量7649万吨，其中，牛肉产量667万吨，增长3.6％；羊肉产量488 万吨，增长2.6％；禽肉产量2239万吨，增长12.3％；禽蛋产量3309万吨，增 长5.8％；牛奶产量3201万吨，增长4.1％；猪肉产量4255万吨，下降21.3％。 可见，家鸡产业已成为保障动物蛋白需求的支柱产业。

我国拥有家鸡品种资源最多的国家，为家鸡的研究与开发利用提 供了宝贵的遗传资源。但我国家鸡市场仍有一半是国外高度选育的白 羽肉鸡，极易受到外国种源价格的影响，且品种多元化，而本土种业 整体上没有真正建立起以本土品种为核心技术的产业发展模式，导致 本地资源开发利用严重滞后，利用家鸡资源培育新品种的工作开展不 到位，育种方式落后，一些自动化程度高、测定准确的性状量化测定 设备设施少，对肉品质、繁殖、饲料转化率以及抗病等重要经济性状 的遗传进展缓慢。这导致家鸡育种选择强度低、育种周期长、育种成 本高，整体育种效率低。面对巨大的鸡肉需求量和不断增加的现状，虽然我国家鸡企业满足了部分优质鸡肉内需，但整体上市场缺口依旧 极大，种源及产量严重不足，亟需开展培植家鸡种业、做强家鸡种业、 培育新品种(配套系)等方面的工作。

屠宰性能是家禽育种中重要的表型性状，与经济性能有极大关联，是反映 产肉性能的最重要同时也是最直观的指标，其中全净膛重可反映家鸡的生长发 育和产肉情况。因此，采用全基因组关联分析的方法找到与家鸡全净膛重相关 的SNP分子标记，对我国家鸡育种有着重要的意义。

发明内容

鉴于以上技术背景，本发明的首要目的在于提供一个影响鸡全净膛重的 SNP分子标记及。本发明基于云南地方鸡种与隐性白洛克肉鸡F2代资源群体， 运用全基因组关联分析的方法寻找与鸡全净膛重相关的SNP分子标记，以此作 为鸡全净膛重相关的SNP分子标记在标记辅助选择中的应用。

本发明的另一目的在于提供上述影响鸡全净膛重的分子标记在鉴定鸡产肉 性能和遗传育种中的应用。

本发明的再一目的在于提供一种影响鸡全净膛重的分子标记基因分型检测 方法。

本发明的第四个目的在于提供一种影响鸡全净膛重的分子标记基因分型在 鉴定鸡产肉性能中的应用。

本发明的第五个目的在于提供一种影响鸡全净膛重的分子标记基因分型在 鸡遗传育种中的应用。

本发明的目的是通过以下技术方案实现的：

一种影响鸡全净膛重的SNP分子标记的获得方法，其在于下列步骤：

1)组建大围山微型鸡和隐性白洛克肉鸡F2代资源群体，获得741只试验 鸡，均于90日龄时测定全净膛重；

2)提取F2代群体鸡基因组DNA；