[发明专利]一种与小麦旗叶长QTL QFll-2B连锁的KASP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与小麦旗叶长QTL QFll‑2B连锁的KASP分子标记及其应用，该分子标记位于RefSeqv1.0基因组的2B染色体长臂上。检测分析表明，该分子标记能准确跟踪所述小麦旗叶长QTL QFll‑2B，预测小麦的旗叶长特性，进而方便进行分子育种。本发明还公开了一种鉴定小麦旗叶长QTL QFll‑2B的分子标记的方法，利用本发明所提供的方法能够加强旗叶长的预测的准确性，能更快速筛选出具有较长旗叶的小麦品种或品系用于育种，大大加快小麦育种的进程。

技术领域

本发明属于分子生物学及作物遗传育种技术领域，具体涉及一种与小麦旗叶长QTL QFll-2B连锁的KASP分子标记及其应用。

背景技术

普通小麦(Triticum aestivum L.)是世界上最重要的作物之一，其播种面积占全国耕地面积的20％-30％。它是35％人口的主要食物。据报道，小麦生产应该增加70％以满足未来的粮食需求。

随着人口的增加、可利用耕地面积的减小，提高小麦产量是解决粮食需求矛盾的重要途径。光合作用是作物干物质积累和产量形成的基础，叶片是小麦进行光合作用的主要器官，因此旗叶大小对小麦的最终产量具有很大的影响。旗叶长是一种重要的农艺性状，既是小麦株型的重要构成因素之一，也是植物光合作用的主要器官，在小麦中对产量潜力起着重要作用。在灌浆期，种子的有机物一半是由旗叶提供，直接影响小麦的产量。此外，旗叶决定了小麦的冠层结构，它影响开花时间，光照量，光合作用，种子灌浆，并最终影响每株植物的籽粒产量。

小麦产量性状是复杂的数量性状，受多个数量性状基因位点(Quantitativetrait locus，QTL)控制，具有遗传力低、受环境影响大、选择难度高的特性，所以在选育过程中，传统的育种方法存在时间长、消费大、成本高、成果小的问题。分子标记辅助育种，不依赖于表型选择，即不受环境、基因互作、基因与环境互作等因素的影响，而是直接对基因型进行选择，因而能大大提高育种效率。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)指的是基因组内DNA某一特定核苷酸位置上存在转换、颠换、插入、缺失等变化而引起的DNA序列多态性。其技术是利用己知序列信息来比对寻找SNP位点，再利用发掘的变异位点设计特异性的引物来对基因组DNA或cDNA进行PCR扩增，得到基于SNP位点的特定的多态性产物，最后利用电泳技术分析产物的多态性。SNP标记的优点是数量多，分布广泛；在单个基因和整个基因组中分布不均匀；SNP等位基因频率容易估计。

KASP是由LGC公司(Laboratory of the Government Chemist)(http://www.lgcgenomics.com)研发的竞争性等位基因特异性PCR技术(Kompetitive AlleleSpecific PCR,KASP)具有低成本、高通量特点的新型基因分型技术，通过引物末端碱基的特异匹配来对SNP以及In Del位点进行精准的双等位基因分型，在水稻、小麦、大豆等作物的分子标记辅助选择中得到广泛应用。

此前部分学者对旗叶长进行了QTL定位，发现与之相关的QTL在小麦中广泛存在，并且分布在小麦的各个染色体上。然而目前与小麦旗叶长性状相关且可用于实际分子育种的紧密连锁的分子标记却并不多。因此研究获得有关旗叶长的QTL或基因，利用分子生物学技术，选择合适旗叶长植株，进而提高作物光合作用，最终达到选育增产小麦新品种的目的，在小麦育种工作中意义重大。

发明内容

针对现有技术中的上述不足，本发明提供一种与小麦旗叶长QTL QFll-2B连锁的KASP分子标记及其应用，本申请公开的分子标记KASP-Fll-sau1与旗叶长QTL QFLL-2B极显著相关，呈现紧密连锁标记特征，用于分子标记辅助选择的准确性高，可显著提高不同环境下较长旗叶小麦品种的选择鉴定效率，且成功率高。