[发明专利]微胶囊组合物及方法在审

专利信息
申请号: 202010761140.6 申请日: 2013-08-13
公开(公告)号: CN111748607A 公开(公告)日: 2020-10-09
发明(设计)人: 本杰明·辛德森;瑟奇·萨克森诺夫 申请(专利权)人: 10X基因组学有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 代理人: 武晶晶
地址: 美国加利*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 微胶囊 组合 方法
【权利要求书】:

1.一种用于样品制备的方法,其包括:

a)提供包含凝胶珠粒和核酸分析物的分区,其中所述凝胶珠粒包含与其偶联的至少1,000,000个寡核苷酸分子,其中所述至少1,000,000个寡核苷酸分子包含共同的条形码序列;

b)施加刺激以从所述凝胶颗粒释放所述至少1,000,000个寡核苷酸分子,其中所述至少1,000,000个寡核苷酸分子的寡核苷酸分子在所述分区中附接至所述靶分析物;且

c)使附接至所述核酸分析物的所述寡核苷酸分子进行核酸延伸反应以获得条形码化的核酸产物。

2.如权利要求1所述的方法,其中所述分区是微滴或孔。

3.如权利要求1所述的方法,其中所述至少1,000,000个寡核苷酸分子与所述凝胶珠粒经由不稳定的部分偶联。

4.如权利要求3所述的方法,其中所述不稳定的部分是二硫键。

5.如权利要求1所述的方法,其中所述刺激选自下组:生物刺激、化学刺激、热刺激、电刺激、磁刺激和光刺激。

6.如权利要求5所述的方法,其中所述刺激是化学刺激,所述化学刺激是还原剂。

7.如权利要求6所述的方法,其中所述还原剂是二硫苏糖醇(DTT)或三(2-羧乙基)膦(TCEP)。

8.如权利要求1所述的方法,其中所述至少1,000,000个寡核苷酸分子的所述寡核苷酸分子包含在所述核酸延伸反应过程中作为引物发挥功能的区域。

9.如权利要求8所述的方法,其中所述作为引物发挥功能的区域具有用于随机引发的序列。

10.如权利要求8所述的方法,其中所述引物经配置以扩增所述核酸分析物,由此产生所述条形码化的核酸产物。

11.如权利要求1所述的方法,其中所述分区进一步包含聚合酶。

12.如权利要求11所述的方法,其中所述寡核苷酸分子包含尿嘧啶且所述聚合酶不识别尿嘧啶。

13.如权利要求1所述的方法,其中所述核酸分析物选自下组:脱氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)、扩增子、合成的多核苷酸、多核苷酸、寡核苷酸、互补的DNA(cDNA)、双链DNA(dsDNA)、单链DNA(ssDNA)、质粒DNA、粘粒DNA、高分子量(MW)DNA、染色体DNA、基因组DNA、病毒DNA、细菌DNA、线粒体DNA(mtDNA)、信使RNA(mRNA)、核糖体RNA(rRNA)、转移RNA(tRNA)、核RNA(nRNA)、短干扰RNA(siRNA)、小核RNA(snRNA)、小核仁RNA(snoRNA)、小卡哈尔体特异性RNA(scaRNA)、微小RNA(microRNA)、双链RNA(dsRNA)、核酶、核糖开关和病毒RNA。

14.如权利要求1所述的方法,其中所述至少1,000,000个寡核苷酸分子与所述凝胶珠粒经由共价键偶联。

15.如权利要求1所述的方法,其中所述至少1,000,000个寡核苷酸分子可逆固定至所述凝胶珠粒。

16.如权利要求1所述的方法,其中(a)中的所述分区包含多个核酸分析物,所述多个核酸分析物包含所述核酸分析物。

17.如权利要求16所述的方法,其中所述多个核酸分析物种的每一个附接至所述至少1,000,000个寡核苷酸分子的单个寡核苷酸分子。

18.如权利要求16所述的方法,其进一步包括片段化核酸样品以获得所述多个核酸分析物。

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