[发明专利]一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的SSR引物及方法

说明书

本发明提供一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的SSR引物SSR06；本发明还提供了一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的方法，包括：步骤1，提取待测样品云萝卜2号杂交种基因组DNA；步骤2，以步骤1所提取的云萝卜2号杂交种基因组DNA作为模板，采用上述SSR引物SSR06进行PCR扩增；步骤3，将步骤2中的扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染法染色，照相并统计结果；步骤4，利用步骤3的统计结果计算云萝卜2号杂交种的纯度。发明提供的SSR引物SSR06特异性高，鉴定结果准确；且本发明的鉴定方法，能快速、准确、便捷的鉴定杂交种子的纯度，克服了田间小区种植鉴定杂交种纯度费时、费力的缺点。

技术领域

本发明涉及杂交种子纯度鉴定技术领域，尤其涉及一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的SSR引物及方法。

背景技术

萝卜(Raphanus sativusL.)为十字花科(Brassi-caceae)萝卜属(Raphanus)蔬菜，在中国常年栽培面积仅次于大白菜，在农业生产中占有重要地位。萝卜的种植区域广泛，种植品种多，干制加工型萝卜是秋冬季云南山区重要的特色农业支柱产业，依托云南独特的气候优势得以迅速发展。据统计，2018年云南省萝卜种植面积约为110万亩，主要种植于曲靖、昭通、楚雄、红河等地区。近年来随着云南省加工型萝卜条的外销和出口产值不断提高，对加工型萝卜的条形和品质也提出了更高的要求，选育出产量高、品质优的加工型萝卜品种也变得更为迫切。云萝卜2号是云南省农业科学院园艺作物研究所选育运用雄性不育技术获得的杂交一代干制加工型萝卜品种，具有肉质根皮、肉白色、根型长直、干物质含量高、抗病性强、加工品质优良等优点，已在云南省楚雄州、红河州、陆良县等干制加工基地规模化推广种植，随着该品种种植面积的不断扩大，种子需求量和制种面积也相应增加。云萝卜2号杂交种生产过程中，父母本按照一定比例分行种植，并与其他品种或者类型的十字花科作物保持2000m以上的隔离距离；母本植株开花后拔出混杂的可育株，利用昆虫等传粉媒介或者人工辅助授粉的方式，获得杂交种子。但制种时母本中可育株未完全去除、田间隔离措施不完善、收获前父本没有及时拔出、收获后其他品种混入都会导致假杂种的产生。目前田间小区种植鉴定是干制加工型萝卜种子纯度鉴定的主要手段，存在工作量大、周期长、易受经验和环境影响等缺点，可能错过杂交种最佳的销售和播种时间。

因此，寻找一种准确、快速的鉴定杂交种纯度的方法是非常重要的，有利于云萝卜2号的进一步推广应用。

发明内容

为了解决上述相关领域中的不足，本发明提供一种用于云萝卜2号杂交种子纯度鉴定的SSR引物SSR06及其鉴定方法。

本发明的一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的SSR引物及方法是通过以下技术特征实现的：

一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的SSR引物，其特征在于，所述SSR引物为SSR06，包括上游引物和下游引物；

所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。

引物SSR06的上游引物和下游引物的具体单链DNA序列从5’到3’端分别为：

上游引物：GAAGCAGATGATTGCAAAACC(SEQ ID NO:1)；

下游引物：CATCCGTTTTGAAGATGGAAA(SEQ ID NO:2)。

一种鉴定云萝卜2号杂交种子纯度的方法，其特征在于，所述方法包括：

步骤1，提取待测样品云萝卜2号杂交种基因组DNA；

步骤2，以步骤1所提取的云萝卜2号杂交种基因组DNA作为模板，采用所述SSR引物SSR06进行PCR扩增；

步骤3，将步骤2中的扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染法染色，照相并统计结果；