[发明专利]与小麦株高主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了与小麦株高主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用。与小麦株高性状相关的分子标记有2个，1个是以小麦京411基因组DNA为模板，用SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示的引物对I进行PCR扩增得到的DNA片段，记为qPH‑5A‑ID2；另外1个也是以小麦京411基因组DNA为模板，用SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的引物对II进行PCR扩增得到的DNA片段，记为qPH‑5A‑ID3。本发明提供的分子标记qPH‑5A‑ID2和qPH‑5A‑ID3，与qPH‑5A紧密连锁，能促进该位点在推广品种中转移应用，也有利于该位点与其它产量相关位点的聚合育种。

技术领域

本发明涉及分子标记及其应用，具体涉及与小麦株高主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用，属于作物选种培育技术领域。

背景技术

小麦是世界总产量排名第二的粮食作物，为人类提供约20%的食物热量和蛋白质。预计到2050年世界人口将增长至96亿，小麦产量需要每年增加1.6%才能满足未来需求。株高是小麦株型重要的构成因子，与光合效率及产量密切相关。因此，解析产量相关性状的分子遗传学基础，挖掘株高优异等位基因并利用于育种，将有助于小麦高产新品种的培育，保障我国粮食安全和农业可持续发展。

目前，小麦21条染色体上均有报道控制株高的QTLs，在申请的专利中，也有与株高紧密连锁的分子标记。然而，关于5A位点的小麦株高主效QTL报道很少，且靶位点目前没有相关专利报道。

发明内容

本发明的第一个目的在于：在小麦5A位点寻找一个新的株高主效QTL qPH-5A。

本发明的第二个目的在于：开发2个与靶位点株高主效QTL qPH-5A紧密连锁的分子标记qPH-5A-ID2和qPH-5A-ID3。

为了实现上述目标，本发明首先提供了用于鉴定或辅助鉴定小麦株高性状的引物对、制备上述引物对的方法以及用于鉴定或辅助鉴定小麦株高性状的产品。

本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定小麦株高性状的引物对，其特征在于，所述引物对由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2 所示的两条单链DNA组成，记为引物对I；或者，由SEQID NO:3和SEQ ID NO:4所示的两条单链DNA组成，记为引物对II。

本发明所提供的制备上述引物对的方法，其特征在于，包括将组成前述的引物对I或引物对II的两条单链DNA分别单独包装的步骤。

本发明所提供的用于鉴定或辅助鉴定小麦株高性状的产品，其特征在于，所述产品含有上述的引物对I或引物对II。

为了实现上述目标，本发明还提供了鉴定或辅助鉴定小麦株高性状的方法。

本发明所提供的鉴定或辅助鉴定小麦株高性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：

步骤1：提取待测小麦的基因组DNA；

步骤2：以待测小麦的基因组DNA为模板，用前述的引物对I和引物对II采用多重引物PCR方式进行PCR扩增，得到PCR产物I和PCR产物II；

步骤3：将上述PCR产物I和PCR产物II一起进行凝胶电泳，根据电泳结果确定待测小麦的株高性状：如果出现了分子量大小为288bp或227bp的扩增片段，则该待测小麦存在使小麦株高增加的基因，预测该小麦品种或品系具有增加小麦株高的QTL位点，否则，该小麦品种或品系不具有增加小麦株高的QTL位点。

在步骤2中，PCR扩增反应体系为10μL，包括：

（1）1μL浓度为2μmol/L的SEQ ID NO:1所示的上游引物；