[发明专利]基于KASP技术开发的瓠瓜核心分子标记集及其应用

权利要求书

1.一种瓠瓜核心分子标记集，其特征在于：该瓠瓜核心分子标记集由22个SNP标记组成，所述22个SNP标记分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、SNP18、SNP19、SNP20、SNP21和SNP22，

所述SNP1标记位于瓠瓜1号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第8431159位的碱基为A或T；

所述SNP2标记位于瓠瓜1号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第14051095位的碱基为T或A；

所述SNP3标记位于瓠瓜2号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第589455位的碱基为T或C；

所述SNP4标记位于瓠瓜2号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第15914116位的碱基为G或A；

所述SNP5标记位于瓠瓜3号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第3421007位的碱基为A或T；

所述SNP6标记位于瓠瓜3号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第28241399位的碱基为T或C；

所述SNP7标记位于瓠瓜4号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第5104280位的碱基为T或C；

所述SNP8标记位于瓠瓜4号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第20784251位的碱基为C或A；

所述SNP9标记位于瓠瓜5号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第1706273位的碱基为C或T；

所述SNP10标记位于瓠瓜5号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第27139793位的碱基为T或C；

所述SNP11标记位于瓠瓜6号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第1594854位的碱基为A或G；

所述SNP12标记位于瓠瓜6号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第5974943位的碱基为G或A；

所述SNP13标记位于瓠瓜7号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第11605465位的碱基为T或C；

所述SNP14标记位于瓠瓜7号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第23829758位的碱基为T或C；

所述SNP15标记位于瓠瓜8号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第20000834位的碱基为A或G；

所述SNP16标记位于瓠瓜8号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第22529614位的碱基为T或C；

所述SNP17标记位于瓠瓜9号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第10095406位的碱基为T或C；

所述SNP18标记位于瓠瓜9号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第18607803位的碱基为A或G；

所述SNP19标记位于瓠瓜10号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第2343761位的碱基为C或A；

所述SNP20标记位于瓠瓜10号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第4261004位的碱基为T或C；

所述SNP21标记位于瓠瓜11号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第14865743位的碱基为G或T；

所述SNP22标记位于瓠瓜11号染色体，其在瓠瓜全基因组序列第15431610位的碱基为G或A；

所述瓠瓜全基因组序列的版本号为Lagenaria siceraria cv. 'HangzhouGourd'2.0。

2.用于检测如权利要求1所述瓠瓜核心分子标记集的引物对，其特征在于：所述引物对包含22个KASP引物组，每个KASP引物组用于检测对应的SNP标记；每个KASP引物组由两条末端碱基不同的等位基因正向引物F1、F2和一条反向引物R组成。

3.根据权利要求2所述的引物组，其特征在于：

所述正向引物F1的5’端添加FAM荧光标签，所述FAM荧光标签序列为5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’；

所述正向引物F2的5’端添加HEX荧光标签，所述HEX荧光标签序列为5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’。

4.一种芯片或者检测试剂盒，其含有如权利要求2所述的引物组，其特征在于，所述引物组为粉末固态或者液态。

5.检测权利要求1所述的瓠瓜核心分子标记集的引物在瓠瓜品种鉴定中的应用。