[发明专利]生物反应器病毒感染细胞质量评价方法有效
申请号: | 201911137046.7 | 申请日: | 2019-11-19 |
公开(公告)号: | CN110853030B | 公开(公告)日: | 2023-08-25 |
发明(设计)人: | 宫平;李清亮;马辰昊;郭红壮;葛辉琼;张宁;阚宝慧;朱海焕;吴昊;李旭;吉翔宇;谭国桢 | 申请(专利权)人: | 长春理工大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/136;G06T7/187;G06T7/62 |
代理公司: | 西安铭泽知识产权代理事务所(普通合伙) 61223 | 代理人: | 耿路 |
地址: | 130022 吉林*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生物反应器 病毒感染 细胞 质量 评价 方法 | ||
本发明公开了生物反应器病毒感染细胞质量评价方法,涉及生物反应器技术领域,方法包括计算显著图、显著图分割、连通区域标记和感染细胞标记,本发明首次将显著性方法应用在感染质量评价中,实现了病毒感染细胞状态客观评价,解决了主观评价和经验评价误差较大,不能定量分析的问题。
技术领域
本发明涉及生物反应器技术领域,特别是涉及生物反应器病毒感染细胞质量评价方法。
背景技术
生物反应器是通过模拟酶或生物体(如细胞、微生物等)在体生长环境,来实现离体培养的一种通过生物反应或者自身代谢得到预期产物的装置。生物反应器在疫苗生产、单克隆抗体制备、医药生产、肿瘤防治、酿酒、生物发酵、有机污染物降解等方面都发挥着重要的应用。
在生物制药领域很大一部分应用生物反应器培养细胞是为了作为病毒增殖的载体,而在正常细胞背景下对被病毒感染细胞的状态自动评价难度较大。目前都是采用人主观视觉评价或依据经验在特定条件下以感染时间作为病毒感染程度评价指标。主观评价和经验评价误差较大,而且不能定量分析。
发明内容
本发明实施例提供了生物反应器病毒感染细胞质量评价方法,可以解决现有技术中存在的问题。
本发明提供了生物反应器病毒感染细胞质量评价方法,包括以下步骤:
利用GBVS模型计算图像的显著图;
采用二维最大熵算法计算所述显著图的最显著区域分割阈值,根据该分割阈值将显著图分割为多个分级显著区域,该分级显著区域包括各级的显著目标和非显著背景;
对各级的显著区域进行二值化并按照显著图分割区域进行合并,得到最终的分割结果;
对分割后的图像中的连通区域进行标记,构建标准细胞面积的标准细胞模板,利用该标准细胞模板对标记的连通区域采用模板匹配方法进行感染细胞标记。
本发明中的生物反应器病毒感染细胞质量评价方法,方法包括计算显著图、显著图分割、连通区域标记和感染细胞标记,本发明首次将显著性方法应用在感染质量评价中,实现了病毒感染细胞状态客观评价,解决了主观评价和经验评价误差较大,不能定量分析的问题。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为二维灰度直方图;
图2为分级显著性区域分割算法的流程图;
图3为Oka株水痘病毒感染2BS株二倍体细胞不同感染密度下监测图像;
图4为本发明的评价方法流程图;
图5为不同感染密度下细胞图像模板匹配结果;
图6为本发明的方法与其他常规方法的对比示意图;
图7为水痘病毒感染二倍体细胞的专家标记结果。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
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