[发明专利]应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法在审

专利信息
申请号: 201910848908.0 申请日: 2019-09-09
公开(公告)号: CN110578000A 公开(公告)日: 2019-12-17
发明(设计)人: 尹焕才;刘荻;田晶晶;袁通阔;唐玉国 申请(专利权)人: 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6851
代理公司: 11369 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人: 韩飞
地址: 215163 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 检测 前列腺癌 样本 尿液样本 数字PCR 传统的 尿液 长非编码RNA 荧光定量PCR 待测对象 患者尿液 检测灵敏 血液样本 应用数字 肿瘤组织 尿样 灵敏 自动化 伤害 重复
【权利要求书】:

1.一种应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,该方法将待测对象的尿液作为检测样本,采用数字PCR法对尿液中的前列腺癌特异的lncRNA进行检测。

2.根据权利要求1所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,该方法具体包括以下步骤:

1)采集待测对象的尿液并进行预处理,得到处理后的检测样本;

2)对处理后的检测样本进行RNA提取,获得总RNA;

3)进行逆转录,得到模板;

4)以得到的模板为原料之一配制数字PCR检测体系,并进行数字PCR检测。

3.根据权利要求2所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,所述数字PCR检测体系包括自制预混液、正向引物、反向引物、HotstartHiTaq、双蒸水以及所述步骤4制得的模板。

4.根据权利要求3所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,所述自制预混液包括以下原料:MgCl2、NH4Cl、Tris-HCl、BSA、dNTP、甘油、海藻糖、Poloxamer 188、EvaGreen、鱼精DNA、Tween-20和NaN3

5.根据权利要求2所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,所述步骤1)具体包括:

1-1)将待测对象的尿液收集至无菌离心管中;

1-2)4℃、3000r/min离心5分钟,弃上清,收集尿沉渣;

1-3)将尿沉渣使用PBS溶液重悬,于4℃、3000r/min离心5分钟,弃上清,收集尿沉渣;

1-4)将尿沉渣收集于离心管中,加入Trizol试剂反复吹打均匀,得到处理后的检测样本,放入-80℃冰箱备用或直接进行RNA提取。

6.根据权利要求2所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,所述步骤2)具体包括:

2-1)向所述步骤1)制得的处理后的检测样本中加入Trizol溶液,涡旋混匀,静置五分钟;

2-2)向每1mlTrizol溶液中加入0.2ml氯仿,涡旋混匀静置2-3分钟;

2-3)4℃、12000g离心15分钟,吸取上清水相至新的1.5ml离心管中;

2-4)向每1ml Trizol溶液得到的上清中加入10μg无RNA酶的糖原和0.5ml异丙醇,涡旋混匀后静置10分钟;

2-5)4℃、12000g离心10分钟,弃去上清;

2-6)向每1ml Trizol溶液得到的沉淀中加入1ml体积分数为75%的乙醇,颠倒混匀;

2-7)4℃、7500g离心5分钟,弃去上清;

2-8)将得到的RNA沉淀静置干燥5-10分钟;

2-9)将RNA沉淀使用20-50μl无RNA酶水重悬,得到提取的总RNA,保存于-80℃冰箱备用或直接进行逆转录。

7.根据权利要求2所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,所述步骤3)具体包括:

3-1)去除基因组DNA反应:将步骤2)得到的总RNA为原料之一配制反应混合液,进行反应,去除总RNA中的基因组DNA;

3-2)逆转录反应:以步骤3-1)得到的反应产物为原料之一配制反应混合液,进行逆转录反应,得到模板。

8.根据权利要求2所述的应用数字PCR检测前列腺癌患者尿液中长非编码RNA的方法,其特征在于,所述扩增反应程序为:98℃保持30s;95℃保持15s、68℃保持1min并重复40个热循环;68℃保持10min;12℃保温,程序结束。

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