[发明专利]一种肠道菌群检测分析方法、装置、系统及存储介质

说明书

一种肠道菌群检测分析方法，其特征在于，该方法包括：采集粪便样本后立刻与DNA保护液相混合；常温下转移粪便样本；提取粪便样本总DNA；对样本总DNA进行16S rRNA的扩增获取纯化DNA；将纯化后的DNA进行文库制备及测序；根据测序数据分析样本粪便的生物信息生成报告；解读报告上的分析结果。本发明将复杂生物信息分析流程整合成一套自动化分析软件，不论是专业生物信息分析人员还是普通实验人员，按照指定格式准备输入文件和数据，可以全自动完成分析，拿到最终结果。

技术领域

本发明属于肠道菌群检测技术领域，尤其涉及一种中国健康人群肠道微生物菌群检测分析方法、装置、系统及计算机可读存储介质。

背景技术

人体微生物被视为人体第二基因组，每个人肠道、口腔、皮肤等都寄生或共生着成千上万种微生物,它们的数量远远超过人体细胞数量。目前科研以及检测公司常用的微生物检测方法较为类似，通过对 16S rRNA基因V1-V3、V3-V4或V4区进行PCR扩增测序并分析得出受检者肠道微生物状态。然而，现有的生物信息分析门槛高，需要经验丰富的专业生物信息分析人员才能完成；所分析菌落种类无明确目标，对所有菌群分析，给出结果对受检者或医生无明确指导意义；现有系统只支持单个区域的分析和检测，对数据来源要求有严格限制。

发明内容

本发明的目的在于提供一种肠道菌群检测分析方法、装置、系统及计算机可读存储介质，旨在解决现有生物分析过程太复杂，无法直接获得指导性结果的问题。

为了解决上述技术问题，本发明提供了一种肠道菌群检测分析方法，其特征在于，该方法包括：

采集粪便样本后立刻与DNA保护液相混合；

常温下转移粪便样本；

提取粪便样本总DNA；

对样本总DNA进行16SrRNA目标片段进行扩增，使用试剂盒提纯 PCR产物获取纯化目标DNA；

将纯化后的DNA进行文库制备及测序；

根据测序数据分析样本粪便的生物信息生成报告；

解读报告上的分析结果。

具体地，所述采集粪便样本后立刻与DNA保护液相混合的步骤具体包括：

准备采集管；

用采集管采集粪便样本；

封装存有粪便样本的采集管。

具体地，所述提取粪便样本总DNA的步骤具体包括：

提取采集管内粪便样本的总DNA；

检测总DNA的完整性；

检测总DNA的纯度。

具体地，所述对样本总DNA进行16S rRNA的扩增获取纯化DNA 的步骤具体包括：

合成PCR引物，

PCR引物扩增得到足量的PCR产物；

电泳检测PCR产物；

切取PCR产物400-500bp附近的明亮DNA条带；

将含有目标片段的明亮DNA条带转入纯化试剂盒获取纯化DNA。

具体地，所述将纯化后的DNA进行文库制备及测序的步骤具体包括：

将存有纯化DNA的PCR管放到PCR仪中在55℃孵育5分钟；

文库洗脱缓冲液注入到PCR中；

PCR管在PCR仪上进行文库扩增；