[发明专利]一种用于宫颈癌甲基化检测的甲基化基因组合、引物和探针组合、试剂盒及其使用方法在审

专利信息
申请号: 201910687592.1 申请日: 2019-07-29
公开(公告)号: CN110452984A 公开(公告)日: 2019-11-15
发明(设计)人: 韩林志;肖芳;李翔;李书 申请(专利权)人: 韩林志
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 11569 北京高沃律师事务所 代理人: 吕纪涛<国际申请>=<国际公布>=<进入
地址: 410000湖南省长沙市*** 国省代码: 湖南;43
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摘要:
搜索关键词: 甲基化检测 宫颈癌 甲基化 引物 样本 基因检测技术 实时荧光PCR 基因组合 内参基因 启动子区 探针组合 预后判断 早期诊断 样本DNA 常规的 高通量 试剂盒 硫化 扩增 探针 灵敏 基因 医学
【权利要求书】:

1.一种用于宫颈癌甲基化检测的甲基化基因组合,包括以下甲基化基因:FAM19A4、has-miR-124-2和ZNF671。

2.一种用于宫颈癌甲基化检测的引物和探针组合,其特征在于,所述引物和探针用于检测权利要求1所述FAM19A4、has-miR-124-2和ZNF671;所述引物和探针组合包括FAM19A4正向引物F、FAM19A4反向引物R、FAM19A4探针P、has-miR-124-2正向引物F、has-miR-124-2反向引物R、has-miR-124-2探针P、ZNF671正向引物F、ZNF671反向引物R和ZNF671探针P;

所述FAM19A4正向引物F、FAM19A4反向引物R、FAM19A4探针P、has-miR-124-2正向引物F、has-miR-124-2反向引物R、has-miR-124-2探针P、ZNF671正向引物F、ZNF671反向引物R和ZNF671探针P的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:9所示。

3.根据权利要求2所述的引物和探针组合,其特征在于,所述FAM19A4探针P、ZNF671探针P和has-miR-124-2探针P的5’端采用FAM标记;所述FAM19A4探针P、ZNF671探针P和has-miR-124-2探针P的3’端采用MGB标记。

4.一种用于宫颈癌甲基化检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求2或3所述的引物和探针组合、β-actin正向引物F、β-actin反向引物R和β-actin探针P;所述β-actin正向引物F、β-actin反向引物R和β-actin探针P的核苷酸序列如SEQ ID NO:10~SEQID NO:12所示。

5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述β-actin探针P的5’端采用VIC标记;所述β-actin探针P的3’端采用MGB标记。

6.根据权利要求4或5所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括10×PCRBuffer,Taq酶、dNTPs、无核酸酶水、阳性对照和阴性对照。

7.根据权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性对照包括宫颈癌细胞株CaSki;所述阴性对照包括宫颈癌细胞株C33A。

8.权利要求4~7任意一项试剂盒的使用方法,包括以下步骤:

1)提取待检样本DNA;

2)将所述待检样本DNA经亚硫酸盐转化处理,得到转化后的DNA;

3)以所述转化后的DNA为模板,利用权利要求2或3所述的引物和探针组合进行PCR扩增反应,得到荧光检测结果;

4)根据所述荧光检测结果,对待检样本进行判定,当β-actin≤35,且检测结果为FAM19A4或miR-124-2任一基因ΔCt≦9,则判定待检样本为宫颈癌甲基化阳性;当β-actin≤35,且检测结果为FAM19A4、has-miR-124-2、ZNF671基因ΔCt>9,则判定待检样本为FAM19A4、has-miR-124-2、ZNF671甲基化阴性;当β-actin>35,则判定样本不足或有抑制物存在,PCR反应无效,需重复实验或采样;

所述ΔCt=FAM Ct-VIC Ct。

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