[发明专利]与小麦有效分蘖数QTL连锁的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.与小麦有效分蘖数QTL QPTN.sau-4B连锁的SNP分子标记，其特征在于，所述分子标记为KASP-1，其与小麦有效分蘖数QTL QPTN.sau-4B共定位于小麦4B染色体短臂上，且与QPTN.sau-4B之间的遗传距离2.1cM；所述SNP分子标记的多态性为C/T；

所述分子标记通过以下引物组合扩增得到，所述引物组合含有3条引物，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1-3所示。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，SEQ ID NO.1-2所示的引物序列在5’ 端分别添加不同的荧光修饰基团，或在3’ 端分别添加不同的荧光修饰基团。

3.一种引物组合物，其特征在于，含有核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1-3所示的引物。

4.权利要求1-2任一所述的SNP分子标记或权利要求3所述的引物组合物在培育转基因小麦或小麦种质资源改良中的应用。

5.权利要求1-2任一所述的SNP分子标记或权利要求3所述的引物组合物在培育多有效分蘖数小麦或高产小麦中的应用。

6.权利要求1-2任一所述的SNP分子标记或权利要求3所述的引物组合物在筛选具有有效分蘖数增加的小麦品种或品系中的应用。

7.一种鉴定小麦有效分蘖数QTL QPTN.sau-4B的分子标记KASP-1的方法，其特征在于，以待测植株样品的基因组DNA作为模板，利用权利要求3所述的引物组合物对模板进行荧光定量PCR扩增，利用扩增结果进行基因型分型；所述引物组合物中，SEQ ID NO.1-2所示的引物序列在5’ 分别添加不同的荧光修饰基团，或在3’ 分别添加不同的荧光修饰基团，将能够读取到SEQ ID NO.2所标记的荧光基团的植株鉴定为含有小麦有效分蘖数QTLQPTN.sau-4B的植株；

所述分子标记KASP-1，其与小麦有效分蘖数QTL QPTN.sau-4B共定位于小麦4B染色体短臂上，且与QPTN.sau-4B之间的遗传距离2.1cM；所述SNP分子标记的多态性为C/T。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述荧光定量PCR扩增反应体系：5 µLMaster Mix、引物SEQ ID No：1、2和3按照10ng/µL的浓度，分别加入120µL，120µL和300µL并添加ddH₂O 460µL进行混合后作为混合引物使用，混合引物1.4µL、5ng模板DNA、双蒸水加至总量为10µL，同时需添加至少3个独立的以双蒸水代替DNA模板的空白；

荧光定量PCR程序：94℃预变性15min；94℃变性20s、61℃复性/延伸60s，共10个循环；94℃变性20s、55℃复性/延伸60s，共26个循环；完成后进行荧光读值。