[发明专利]一种检测BCORL1基因内含子7基因突变的引物和方法在审

专利信息
申请号: 201910529910.1 申请日: 2019-06-19
公开(公告)号: CN110218773A 公开(公告)日: 2019-09-10
发明(设计)人: 刘赵玲;裘振亚;王淑一 申请(专利权)人: 济南艾迪康医学检验中心有限公司
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 黄素萍
地址: 250013 山东*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 基因内含子 引物 检测结果 种检测 再生障碍性贫血 测序引物 辅助检查 辅助诊断 基因突变 突变检测 突变位点 位点突变 预后 扩增 突变 诊断 参考 疾病 发现
【说明书】:

发明公开了一种检测BCORL1基因内含子7区域51318 A>AG位点突变的引物和方法,其包括(i)扩增BCORL1基因内含子7序列的引物;采用Sanger测序技术和测序引物。采用Sanger测序技术,可快速发现此突变位点。利用本发明完成的检测结果准确,可以辅助检查该区域的突变情况。本发明可快速地将BCORL1基因内含子7区域51318 A>AG突变检测出来。利用本发明完成的检测结果准确,可以辅助诊断AML和再生障碍性贫血,对疾病的诊断和预后有重要的参考意义。

技术领域

本发明属生命科学和生物技术领域,特别涉及检测BCORL1基因内含子7 基因突变的引物和检测方法。

背景技术

BCORL1基因位于X染色体Xq25-q26.1细胞带,大约在129.14至129.19Mb 之间,含有13个外显子,编码1711个氨基酸,是一个转录共抑制因子。在大部 分人正常组织中BCORL1呈现低表达或表达缺失,仅仅在睾丸和前列腺组织呈 现高表达。

BCORL1基因的功能研究发现,其与Ⅱ类组蛋白脱乙酰基酶(histonedeacetylase,H D A C)存在相互作用,如HDAC4、HDAC5和HDAC7,BCOR1 通过结合启动子区域特定位点抑制E—cadherin基因转录,另外,BCORL1也 可以与c端结合蛋白(C—terminalbinding protein,CtBP)协同作用,发挥E —cadherin转录抑制功能。E—cadherin表达受损NSCIC、胃癌、肝细胞癌和卵 巢癌等肿瘤侵袭转移相关,而在包括NSCLC在内的多种肿瘤中,E—cadherin 启动子甲基化状态与其基因表达调控相关。提示BCORL1是一个肿瘤相关促进 基因。

80%BCORL1基因突变发生在原始细胞,细胞系中的所有BCORL1突变都 会截断编码蛋白,从而引起无义突变、剪接位点突变或插入或缺失。所有BCORL1 截断突变都被预测会导致缺乏LXXLL核受体募集模体和C端的多肽严重缩短。 BCORL1突变在AML发病机制中起重要作用,在6%的急性髓性白血病(AML) 患者以及21%的AML细胞系中的存在BCORL1基因突变,BCORL1是一个 新的候选肿瘤促进基因。

除此之外,BCORL1基因突变还和再生障碍性贫血(AA)有关,研究结果 显示,AA突变最常累及的5个基因为PIGA、BCOR/BCORL1、DNMT3A和 ASXL1。BCOR、BCORL1和PIGA基因突变在AA患者中更为显著,而JAK2、 RUNX1、TET2和TP53基因突变在AA中则相对少见。并且,AA患者基因突 变在位点分布上与MDS/AML有高度重叠,主要表现为移码、无义和剪接突变。因此,对再生障碍性贫血的患者检测BCORL1基因突变,有助于了解疾病进程, 而且AA高度特异性突变(如BCOR、BCORL1和PIGA突变)通常提示对免疫 抑制疗法有好的效果并预后良好,生存率高。

由此表明,BCORL1基因突变的检测对再生障碍性贫血疾病进程演变及预后 观测有重要的作用,尤其是在成人急性髓系白血病中的预后判断及治疗药物的选 择具有重要的指导意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种检测BCORL1基因内含子7突变热点的引物,采 用PCR技术,可用于快速检测患者体内BCORL1基因内含子7突变位点的情况。 所述检测BCORL1基因内含子7位点突变情况的引物,包括:

扩增BCORL1基因内含子7的引物,其碱基序列为:

BCORL1-Int7-F:TTTCCTGTTTCTTGCCTTCA

BCORL1-Int7-R:TTCCCATTCTGCAAATCCAC。

进一步地,还包括测序引物,其碱基序列为:

检测BCORL1基因内含子7的测序引物碱基序列为:

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