[发明专利]一种双sgRNA位点敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系统与应用在审
| 申请号: | 201910242004.3 | 申请日: | 2019-03-28 |
| 公开(公告)号: | CN109929845A | 公开(公告)日: | 2019-06-25 |
| 发明(设计)人: | 赵恩峰;贺小宏;王延宾;任江涛;韩露 | 申请(专利权)人: | 南京北恒生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/90;C12N9/22;C12N15/66;C12N5/10;C12Q1/686 |
| 代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 卢倩 |
| 地址: | 210046 江苏省南京市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 敲除 基因 外显子 位点 生物工程技术领域 电泳 鉴定成本 相关基因 肿瘤发生 转染细胞 突变型 细胞株 除法 个位 双位 切割 应用 成功 | ||
1.一种敲除RSPH6A基因的sgRNA,其特征在于,包括RSPH6A sgRNA-1和RSPH6A sgRNA-2;
所述RSPH6A sgRNA-1的序列如下:
RSPH6A sgRNA-1:TCTTTCGGGCGTTCACGATC;
RSPH6A sgRNA-1 oligo1:5’-caccgTCTTTCGGGCGTTCACGATC-3’;
RSPH6A sgRNA-1 oligo2:5’-aaacGATCGTGAACGCCCGAAAGAc-3’;
所述RSPH6A sgRNA-2的序列如下:
RSPH6A sgRNA-2:GGCCCAGATAGCCCGCATCT;
RSPH6A sgRNA-2 oligo1:5’-caccgGGCCCAGATAGCCCGCATCT-3’;
RSPH6A sgRNA-2 oligo2:5’-aaacAGATGCGGGCTATCTGGGCCc-3’。
2.一种双sgRNA位点靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系统,其特征在于,包括权利要求1所述RSPH6A sgRNA-1和RSPH6A sgRNA-2的DNA序列。
3.如权利要求2所述的双sgRNA位点靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系统的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1,使用BsmbI酶切CRISPR/Cas9载体LentiCRISPR V2,得到酶切后的载体;
步骤2,将所述靶向敲除RSPH6A基因的sgRNA的DNA序列磷酸化后与酶切后的LentiCRISPR-V2载体连接,得到得到靶向敲除RSPH6A基因的LentiCRISPR V2-RSPH6AsgRNA-1&LentiCRISPR V2-RSPH6A sgRNA-2,构建靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系统。
4.如权利要求2或3所述靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系统在制备敲除RSPH6A基因的细胞株中的应用。
5.一种敲除RSPH6A基因的细胞株,其特征在于,所述细胞株是运用权利要求2所述双sgRNA位点靶向敲除RSPH6A基因的CRISPR/Cas9系统进行靶向敲除得到的细胞中的RSPH6A基因缺失的细胞株。
6.如权利要求5所述敲除RSPH6A基因的细胞株,其特征在于,所述细胞株为A549细胞株。
7.如权利要求5所述敲除RSPH6A基因的细胞株,其特征在于,所述RSPH6A基因的具体靶向敲除位点为:
AGGATGTGCTGTGTGTGATGCACCCAGTTGGCCATGGAGTCGACCAGCTCCAGCACGGGGATGCCCTCGAAGTCCGGGTTCTCCTCGTAGGAGTCGCGCCCAGCACCACCTTCCTCCTCCTCGTCGCCCTCCTCCTCACTAAACTGGTAGAAGCCCAGCGGGCTGACCTGCGTGGCGGCCAGAT-------------------------------------------------------TCTCGGGCTGGAGTGACGTGGGGCAGCCGCGTCCATGGCAGGCCCGGCTCGTTGCACACAAAGTACAGGTACTTGTTGGCGCCTGAGCGGCTCTCCTCCTTGGGGATCACGGGCGGCGGCTTCCATACGGACTTAGGGACGATGTCCACGGCCTTCTCCTCGTCCTCCTCGCCCTCCTCCTCGCCGTGCGCCTCCATGACCTCGCCACCTTCCGTCATCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCTCGCCCTCCCGGAATTCCACCTCGGCCACCAGGTAGCTGCGTTTGATTCCCAGGAT。
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