[发明专利]发酵香肠中植物乳杆菌的快速定量检测方法在审
| 申请号: | 201910018532.0 | 申请日: | 2019-01-09 |
| 公开(公告)号: | CN109554442A | 公开(公告)日: | 2019-04-02 |
| 发明(设计)人: | 田建军;张开屏;杨明阳;赵丽华;靳烨 | 申请(专利权)人: | 内蒙古农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/06 |
| 代理公司: | 北京君智知识产权代理事务所(普通合伙) 11305 | 代理人: | 黄绿雯 |
| 地址: | 010018 内蒙古*** | 国省代码: | 内蒙古;15 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 植物乳杆菌 发酵香肠 浓度标准曲线 特异性引物 待测样品 快速定量 定量结果 梯度稀释 提取植物 线性方程 直接分析 活菌数 拷贝数 乳杆菌 吻合度 植入物 总DNA 检测 比对 杆菌 菌株 可用 | ||
1.发酵香肠中植物乳杆菌的快速定量检测方法,所述方案包括以下步骤:
(1)植物乳杆菌标准株的DNA提取
将冻干保存的植物乳杆菌标准株接种至MRS液体培养基中,37℃下培养18h,连续活化增殖三代后,利用试剂盒进行菌株基因组DNA提取,用125μL TE buffer溶出DNA;用1%琼脂糖凝胶电泳和ND-1000微紫外分光光度计测量所得产物的质量浓度和光密度值,并将提取的DNA保存在-20℃下备用;
(2)标准品的制作
将步骤(1)得到的DNA原液的稀释至质量浓度100ng/μL得到扩增模板,用植物乳杆菌特异性引物进行PCR扩增,得到340bp目标片段;用1.0%的琼脂糖凝胶电泳对扩增产物进行检测,然后在凝胶成像电泳仪的紫外灯下观察电泳结果,切取目的DNA条带,对目的DNA片段回收、纯化后,通过紫外分光光度计测量所得产物的质量浓度和OD260nm/280nm处光密度值;
(3)建立Ct值-浓度标准曲线
将步骤(1)得到的DNA进行10倍梯度稀释,以所得浓度10-1~10-6的DNA稀释液作为模板,用植物乳杆菌特异性引物对所得模板进行q-PCR扩增,建立Ct值-浓度标准曲线,其中横坐标为DNA浓度的对数,纵坐标为Ct值;
其中,q-PCR的扩增程序为:95℃预变性30s;95℃变性5s,58℃退火30s,72℃延伸30s,共35个循环;72℃延伸10min;
(4)待测发酵香肠样品中菌株总DNA的提取
对发酵香肠进行预处理,采用试剂盒提取待测待测发酵香肠样品中菌株的DNA,-20℃保存;
(5)待测样品中植物乳杆菌的定量分析
以步骤(4)得到的DNA为样品模板,以无菌无酶水作为阴性对照模板,采用植物乳杆菌特异性引物进行q-PCR扩增,得到待测样品中植物乳杆菌的Ct值,所得Ct值与步骤(3)的Ct值-浓度标准曲线进行比对,得到待测样品的植物乳杆菌定量结果。
2.根据权利要求1所述的快速定量检测方法,其特征在于所述植物乳杆菌标准株是植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)37x-6,其于2018年8月1日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,地址100101北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所,保藏编号为CGMCC No.16189。
3.根据权利要求2所述的快速定量检测方法,其特征在于步骤(1)中进行DNA提取时,加入溶菌酶至以总体积浓度计70mg/mL,对标准菌株进行破壁。
4.根据权利要求3所述的快速定量检测方法,其特征在于所述特异性引物为:
lap F:AGCAGTAGGGAATCTTCCA
lap R:CACCGCTACACATGGAG。
5.根据权利要求1所述的快速定量检测方法,其特征在于步骤(2)的扩增体系为:PCRMIX 25μL,正向引物和反向引物各2μL,2μL DNA模板,无菌无酶水补充至50μL;反应程序为:95℃预变性7分钟;95℃变性30s,58℃退火1分钟,72℃延伸30s,共35个循环;72℃延伸10分钟,4℃保存。
6.根据权利要求1所述的快速定量检测方法,其特征在于步骤(5)的q-PCR扩增体系为反应体系为20μL:10μL SYBR,0.4μL DyeⅢ,上下游引物各0.4μL,DNA模板2μL,ddH2O 6.8μL。
7.根据权利要求1所述的快速定量检测方法,其特征在于步骤(4)中,对发酵香肠的预处理包括:取发酵肉肠220mg于2mL离心管中,在冰上操作;加入1.4mL bufferASL涡旋1min,然后95℃处理5min,再涡旋15s,然后12000rpm离心2min;
吸取1.2mL上清液于一新的2mL离心管中,加入1个inhibitEX Tablet到样品中,立刻涡旋1min,室温孵育1min使inhibitEX Tablet充分吸附抑制物;然后12000rpm离心6min,将所有的上清液转移到1.5mL离心管中,弃去沉淀,然后12000rpm 6min。取200μL所得上清液于含有15μL蛋白酶K的1.5mL离心管中,加入200μL的buffer AL,涡旋15S。然后70℃孵育10min,再加入体积浓度为96-100%的200μL的无水乙醇,涡旋混匀;
将混匀的溶解液转移到QIAamp spin colum柱中,12000离心2min;然后向柱子加入500μL buffer AW1,再12000rpm离心2min;再向柱子加入500μL buffer AW2,12000rpm离心6min,弃去含有离心液的收集管,然后12000rpm离心2min;
把上述QIAamp spin colum柱转移到新的离心管中,加入200μL AE,12000rpm离心2min,离心管中即为DNA。
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