[发明专利]荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法及试剂盒在审
| 申请号: | 201811577714.3 | 申请日: | 2018-12-20 |
| 公开(公告)号: | CN109652506A | 公开(公告)日: | 2019-04-19 |
| 发明(设计)人: | 赵丹 | 申请(专利权)人: | 派德洛格(天津)生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6841 | 分类号: | C12Q1/6841;C12Q1/6886 |
| 代理公司: | 天津市三利专利商标代理有限公司 12107 | 代理人: | 杨欢 |
| 地址: | 300000 天津市滨海新区经济技术开发区洞庭路*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 单链DNA 试剂盒 突变 荧光探针 荧光原位 重复序列 聚合酶 限制性内切酶 组织样本检测 蛋白酶处理 分子生物学 核酸外切酶 肿瘤学领域 细胞 基因组DNA 固定单链 环状探针 探针结合 体系结合 乙醇脱水 自我复制 环状DNA 连接酶 平末端 检测 探针 通透 暴露 | ||
1.一种荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,包括下述步骤:
(1)待检测样本固定好后,使用蛋白酶处理体系通透细胞,清洗;
(2)使用二类限制性内切酶处理体系处理细胞基因组DNA,暴露平末端,清洗;
(3)使用核酸外切酶处理体系,从平末端开始沿着5`-3`方向降解单链DNA,保留另一条基因组单链DNA,清洗;
(4)使用探针结合处理体系,荧光探针结合在上一步中保留的基因组单链DNA上,清洗;
(5)使用连接酶处理体系,将探针形成环状DNA,清洗;
(6)使用乙醇脱水处理体系,固定单链基因组DNA和环状探针DNA;
(7)使用聚合酶处理体系,环状探针DNA以单链基因组DNA结合位置为起点,在聚合酶的作用下进行大量自我复制,产生60-70kb左右的含重复序列的单链DNA,清洗;
(8)使用荧光探针结合处理体系,大量的荧光探针结合在含重复序列的单链DNA上,清洗;
(9)使用封片处理体系,封片;
(10)最终在荧光显微镜下观察记录结果。
2.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述的二类限制性内切酶处理体系具体包括:10x CutSmart buffer、10x BSA、PvuII酶和无核酸酶超纯水。
3.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述的探针结合处理体系具体包括:甲酰胺、20x SSC、鲑鱼精子DNA、探针序列5`Pho-GCCCAAAATCTGTGATTCCTTTTACGACGCGATCGTAATCACCTACGAGTTCTTCCAGCAGTTTGGCCC-3`和无核酸酶超纯水。
4.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述连接酶处理体系具体包括:10x T4DNA Ligase buffer、100mM ATP、10xBSA、T4DNA连接酶和无核酸酶超纯水。
5.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述梯度乙醇脱水体系具体包括:乙醇和超纯水。
6.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述聚合酶处理体系具体包括:10x DNA polymerase buffer、100mM DTT、10mMdNTPs、10x BSA、甘油、DNA聚合酶和无核酸酶超纯水。
7.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述荧光探针结合处理体系具体包括:甲酰胺、20x SSC、鲑鱼精子DNA、荧光探针序列5`FAM-CGCGATCGTAATCACC TACGAGT-3`和无核酸酶超纯水。
8.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于,所述封片处理体系具体包括:DAPI、抗淬灭剂、甘油和无核酸酶超纯水。
9.根据权利要求1所述的荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的方法,其特征在于所述清洗处理体系具体包括:Tris-HCl、NaCl、Tween20和无核酸酶超纯水。
10.一种荧光原位检测人EGFR基因21号外显子p.L858R突变的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-9任一项所述的蛋白酶处理体系、二类限制性内切酶处理体系、核酸外切酶处理体系、探针结合处理体系、连接酶处理体系、梯度乙醇脱水体系、聚合酶处理体系、荧光探针结合处理体系、封片处理体系和洗液处理体系。
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