[发明专利]一种免DNA提取的快速SNPs基因分型新方法有效
申请号: | 201811156933.4 | 申请日: | 2018-09-30 |
公开(公告)号: | CN109207570B | 公开(公告)日: | 2022-11-15 |
发明(设计)人: | 程伟;丁世家;黄丽珍;徐璐璐;张路倓;罗妮妮 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京盛凡佳华专利代理事务所(普通合伙) 11947 | 代理人: | 蔡浩 |
地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 提取 快速 snps 基因 新方法 | ||
1.一种免DNA提取的快速MTHFR基因第667位点基因型检测引物,其特征在于:包括正向引物和反向引物,所述正向引物由如SEQ ID NO.3所示片段和如SEQ ID NO.4所示片段组成,所述反向引物为如SEQ ID NO.9所示片段,或所述正向引物由如SEQ ID NO.10所示片段和如SEQ ID NO.11所示片段组成,所述反向引物为如SEQ ID NO.12所示片段。
2.一种用于检测MTHFR基因第667位点基因型的试剂盒,包括权利要求1所述引物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:还包括DNA聚合酶。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:所述DNA聚合酶选自KOD FX DNA聚合酶。
5.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于:还包括酶缓冲液、dNTPs。
6.根据权利要求1所述引物、权利要求2-5任意一项所述试剂盒在免DNA提取的非诊断目的MTHFR基因第667位点基因型检测中的应用。
7.一种免DNA提取的非诊断目的MTHFR基因第667位点基因分型检测新方法,包括如下步骤:
1)设计如权利要求1所述的免DNA提取的快速MTHFR基因第667位点基因型检测引物;
2)将靶物质加入含有前述步骤获得的检测引物、DNA聚合酶、酶缓冲液、dNTPs、水的混合液中进行PCR反应;
3)测定步骤2)所得反应液的比色信号。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中,所述靶物质选自基因组DNA、全血、白细胞、口腔上皮细胞中的至少一种。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中,所述靶物质来源于口腔拭子。
10.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中,PCR循环条件包括预变性,然后变性、退火、延伸循环,再次延伸。
11.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中,预变性条件为95℃,5min。
12.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中,包括如SEQ ID NO.3,SEQID NO.4,SEQ ID NO.9所示片段的引物预变性后,按变性98℃、2min;退火68℃、30s,延伸68℃、30s,35个循环进行。
13.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤2)中,包括如SEQ ID NO.10-12所示片段的引物预变性后,按变性98℃、2min;退火63℃-67℃、30s,延伸68℃、30s,35-45个循环进行。
14.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述步骤3)中,包括如SEQ ID NO.10-12所示片段引物的PCR扩增反应后,向反应液中加入hemin溶液,在室温下反应5-30分钟,形成G4/hemin DNA酶结构,加入新鲜配置的ABTS2-和H2O2作为底物催化显色,用紫外分光光度计测定比色信号。
15.根据权利要求14所述的方法,其特征在于:加入hemin溶液后,其终浓度为1μM。
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