[发明专利]一种具有高特异性的等温核酸扩增体系及其应用有效
| 申请号: | 201810798713.5 | 申请日: | 2018-07-19 |
| 公开(公告)号: | CN108754032B | 公开(公告)日: | 2022-02-18 |
| 发明(设计)人: | 叶辛;方雪恩;孔继烈 | 申请(专利权)人: | 上海速创诊断产品有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844 |
| 代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 俞涤炯 |
| 地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 具有 特异性 等温 核酸 扩增 体系 及其 应用 | ||
1.一种等温核酸扩增体系在儿童腹泻病原体检测中的应用,其特征在于,所述应用为非疾病诊断的应用;所述等温核酸扩增体系包括全长Bst DNA聚合酶,所述全长Bst DNA聚合酶具有5'- 3'双链特异性外切酶活性及聚合活性;
所述等温核酸扩增体系还包括荧光染料,所述荧光染料选自SYBR Green、Ever Green、Pico Green或SYTO系列;
所述等温核酸扩增体系还包括Tris-HCl,KCl,(NH4)2SO4,MgSO4,Tween-20,dNTPs,扩增引物;其中,所述扩增引物包括FOP、ROP、FIP、RIP;
引物FIP和引物RIP标记荧光基团和淬灭基团;其中所述荧光基团选自FAM、HEX、VIC、TET、CY5、Texas Red、JOE、TFAM;所述淬灭基团选自BHQ1、BHQ2、TAMRA、Dabcyl、Eclipse、MGB;
所述等温核酸扩增体系在使用时采用的方法为Exo-NAT,所述Exo-NAT方法的原理为:在65℃的反应条件下,靶序列的双链呈松散的状态,内引物可以与靶序列配对,延伸后,在一侧可形成茎环结构,反向内引物继而配对延伸,当遇到之前形成茎环结构的双链部分时,外切酶活性可以起作用,将这一部分双链剪切掉,反向亦是相同机理,最终可形成产物1;同时两对外引物,也可同时与靶序上的互补区域结合延伸,最终形成产物2。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述儿童腹泻病原体包括A群轮状病毒、星状病毒和/或腺病毒,所述扩增引物包括用于检测A群轮状病毒、星状病毒和/或腺病毒的引物;其中,所述用于检测A群轮状病毒的引物包括如SEQ ID NO.1~ SEQ ID NO.4所示的FOP、ROP、FIP、RIP引物;所述用于检测星状病毒的引物包括如SEQ ID NO.5~ SEQ ID NO.8所示的FOP、ROP、FIP、RIP引物;所述用于检测腺病毒的引物包括如SEQ ID NO.9~ SEQ ID NO.12所示的FOP、ROP、FIP、RIP引物。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述等温扩增体系中各组分的浓度如下:20 mM Tris-HCl,10 mM KCl,10 mM (NH4)2SO4,8mM MgSO4,0.1% Tween-20,0.2μΜ FOP/BOP,1.6μΜ FIP/RIP,5U 全长
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述等温扩增体系的扩增条件为62~68℃,60~120mins。
5.根据权利要求1~4中任一项所述的应用,其特征在于,所述儿童腹泻病原体检测为单重检测或多重检测,其最低检测限为100拷贝/反应。
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