[发明专利]苯丙氨酸羟化酶基因突变谱检测的特异性引物在审
申请号: | 201810273204.0 | 申请日: | 2018-03-29 |
公开(公告)号: | CN108330190A | 公开(公告)日: | 2018-07-27 |
发明(设计)人: | 庞永红;彭磊;于洋 | 申请(专利权)人: | 徐州市妇幼保健院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 徐州市三联专利事务所 32220 | 代理人: | 陈鹏 |
地址: | 221000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 苯丙氨酸羟化酶基因 特异性引物 突变谱 扩增 分子生物学技术 二级结构 发夹结构 分子机制 基因引物 经济实用 突变分析 侧翼区 对引物 外显子 检测 分层 引物 病因 研究 | ||
1.一种苯丙氨酸羟化酶基因突变谱检测的特异性引物,其特征在于,包括13对引物,扩增区域为13个外显子及其侧翼区,引物序列分别为:
所述苯丙氨酸羟化酶基因C1位点,扩增区域为474-533,扩增引物序列是F1:acgaggggcgttactgtg和R1:ccaggaagcaccagcag;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C2位点,扩增区域为4614-4863,扩增引物序列是F2:agagttcatgcttgctttg和R2:tggaagtttgctacgacat;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C3位点,扩增区域为22600-22909,扩增引物序列是F3:gttaggttttcctgttctggt和R3:gtggagttacttatgttgca;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C4位点,扩增区域为39910-40214,扩增引物序列是F4:ttgaacgatagtaatttggg和R4:aggtaagaggaagggag;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C5位点,扩增区域为50823-51072,扩增引物序列是F5:accaagggaaggagacat和R5:caagggagaagcaggctag;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C6位点,扩增区域为62189-62527,扩增引物序列是F6:ccccgactccctctgctaa和R6:cctctgcctcaatcctccc;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C7位点,扩增区域64590-64874,扩增引物序列是F7:gtctcctagtgcctctgact和R7:gcaatgaacccaaacctc;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C8位点,扩增区域65759-66029,扩增引物序列是F8:ctttctgcccattcctca和R8:tacctggtttccgctctt;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C9位点,扩增区域70545-70748,扩增引物序列是F9:ctttctgcccattcctca和R9:tacctggtttccgctctt;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C10位点,扩增区域73035-73438,扩增引物序列是F10:tccagaaacaccctcata和R10:cacagccatcatcaaatc;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C11位点,扩增区域73972-73700,扩增引物序列是F11:ttgggctgtgatgtagaag和R11:tgtcaccacctcaccttact;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C12位点,扩增区域77275-76978,扩增引物序列是F12:tagggaggtgtccgtgtt和R12:gcgatggtagggaaaga;
所述苯丙氨酸羟化酶基因C13位点,扩增区域78520-78309,扩增引物序列是F13:gctttgcactgaggacact和R13:aggtttgcttttcggacttt。
2.根据权利要求1所述的一种苯丙氨酸羟化酶基因突变谱检测的特异性引物,其特征在于,所述苯丙氨酸羟化酶基因C1位点、C2位点、C3位点、C4位点、C5位点、C6位点、C7位点、C8位点、C9位点、C10位点、C11位点、C12位和C13位点的扩增引物序列,其退火温度分别为64℃、60℃、60℃、58℃、59℃、64℃、59℃、50℃、57℃、55℃、60℃、61℃和62℃。
3.根据权利要求1所述的一种苯丙氨酸羟化酶基因突变谱检测的特异性引物,其特征在于,所述苯丙氨酸羟化酶基因C1位点、C2位点、C3位点、C4位点、C5位点、C6位点、C7位点、C8位点、C9位点、C10位点、C11位点、C12位和C13位点的扩增引物序列,其分别依次位于Exon1、Exon2、Exon3、Exon4、Exon5、Exon6、Exon7、Exon8、Exon9、Exon10、Exon11、Exon12和Exon13及各外显子侧翼区。
4.一种权利要求1-3任一项所述检测引物的应用,其特征在于,具体包括步骤:
1)利用PCR-SSCP确定PAH热点突变区域;
2)利用PCR直接测序法,在步骤1)确定的热点突变区域对全部样本扩增,将PCR产物直接Sanger测序。
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