[发明专利]一种福寿螺GK小干扰RNA表达载体及其构建方法和应用在审
申请号: | 201810208895.6 | 申请日: | 2018-03-14 |
公开(公告)号: | CN108588104A | 公开(公告)日: | 2018-09-28 |
发明(设计)人: | 刘光富;俞晓平;张鹏军;申屠旭萍 | 申请(专利权)人: | 中国计量大学 |
主分类号: | C12N15/70 | 分类号: | C12N15/70;C12N15/66;C12N15/85;C12N5/10 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 傅朝栋;张法高 |
地址: | 310018 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 福寿螺 构建 小干扰RNA 表达载体 引物退火 基因全长cDNA 外来入侵生物 大肠杆菌 外来入侵 重组质粒 靶序列 核苷酸 双酶切 福寿 引物 应用 合成 克隆 物种 基因 转化 研究 | ||
1.一种福寿螺GK小干扰RNA表达载体的构建方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)通过RACE技术克隆得到福寿螺GK基因全长cDNA序列;
(2)根据载体的信息和靶序列设计并合成4对含9个核苷酸的loop环的siRNA引物;
(3)siRNA引物退火;
(4)RNAi表达载体的构建:siRNA引物退火后与双酶切的RNAi载体连接;
(5)转化大肠杆菌,得到RNAi表达载体的重组质粒。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的9个核苷为:TTCAAGTAT。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的4对siRNA引物分别为:引物I:
F:5'-AAGCCTCAAAGTTTCAAGTATGTATCGAGT-3',如SEQ ID NO:5所示;
R:5'-AATGTTGGCCGTAAGTTCATACAAGTCAGACT-3',如SEQ ID NO:6所示;
引物II:
F:5'-AAGTGGAATCAATTCAAGTATGTGCTAAGT-3',如SEQ ID NO:7所示;
R:5'-AATGTTGGCCGTTATGAACTT CAAGTCAGACT-3',如SEQ ID NO:8所示;
引物III:
F:5'-AACTCCGAAAGTTTCAAGTATGTATGAGCTA-3',如SEQ ID NO:9所示;
R:5'-AATGTTGGCCGTGAACTTTATCAAGTCAGACT-3',如SEQ ID NO:10所示;
引物IV:
F:5'-AAGTTAGCCATGTTCAAGTATGTATCGAGT-3',如SEQ ID NO:11所示;
R:5'-AATGAACAATGTTTCAAGTATCAAGTCACT-3',如SEQ ID NO:12所示。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(4)为:将表达载体pSilencer2.1-U6 hygro进行BamH I和Hind III双酶切后,与siRNA引物退火后得到的DNA片段连接,采用热激转化大肠杆菌。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)为:利用CODEHOP设计并合成福寿螺GK基因特异性引物,利用RACE技术克隆得到福寿螺GK基因5'端序列和3端序列,拼接后得到福寿螺GK基因全长cDNA序列。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的特异性引物P1-P4是:
P1:5'-CGCTCAGGTCGTAGTAGCAGAAGGTC-3',如SEQ ID NO:1所示;
P2:5'-CGGGAACGGAATGTGAAGAAAGAAGC-3',如SEQ ID NO:2所示;
P3:5'-GGCTTCTTTCTTCACATTCCGTTCCC-3',如SEQ ID NO:3所示;
P4:5'-TGCCTTTCAGGATTACATCACCCG-3',如SEQ ID NO:4所示;。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,将步骤(5)所得到RNAi表达载体的重组质粒利用PCR技术进行阳性鉴定。
8.一种根据权利要求1~7任一所述方法构建的福寿螺GK小干扰RNA表达载体。
9.一种利用权利要求8所述载体分析GK基因在福寿类应对低温胁迫中作用的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)将所述的siRNA表达载体转化大肠杆菌DH5α,37℃,150-200RPM培养12小时后,进行质粒抽提,获得高纯质粒;
(2)将(1)获得的高纯质粒转染福寿螺心组织细胞系,28℃培养12小时后更换新的培养基;
(3)分别在转染后0,6,12,24,72,120小时收集细胞,提取总RNA,分析siRNA表达载体对GK基因表达的影响以及GK的功能。
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