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[发明专利]一种设计靶序列的方法及系统-CN202310802050.0在审
发明人：陈小玲;黄尚飞;陈英;芦志龙;陆琦;陈东;王青艳;吴艳玲 -专利权人：广西科学院
申请日： 2023-07-03 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： G16B30/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种设计靶序列的方法及系统，包括以下步骤：判断当目标序列上有GG(或AG)碱基时，读取所述碱基及所述碱基之前的序列，所述序列的长度为mbp，其中，m≤50；以所述序列为靶序列模型，编辑所述靶序列模型，构建靶序列，其中，所述编辑包括剪切、输入序列信息或读取序列文件；根据所述靶序列评分标准对所述靶序列的序列特征进行分析判断，赋予相应分值后，输出靶序列及其评分数值。本发明方法能为设计的靶序列添加所需的碱基序列，避免人工添加设计的靶序列部分错误而导致基因编辑试验失败。
一种设计序列方法系统

[发明专利]一种快速检查基因打靶特异性的方法及系统-CN202310802061.9在审
发明人：陈小玲;黄尚飞 -专利权人：广西科学院
申请日： 2023-07-03 - 公布日： 2023-10-13 - 主分类号： G16B30/10 文献下载
摘要：本发明涉及一种快速检查基因打靶特异性的方法及系统，包括以下步骤：接收目标基因组的测序数据；在所述目标基因组的测序数据中查找靶序列，将目标基因组上查找到与靶序列一致的序列标记为靶DNA，并记录靶DNA的数量；计算所述靶DNA的总数；判断所述靶DNA的总数是否为1；当判断所述靶DNA的总数是1且靶DNA与靶序列相同时，输出所述靶序列具有特异性。本发明通过以目标生物的基因组为查找范围，在目标基因组中查找与靶序列、靶序列反向互补序列等相同的序列的总数，如果总数为1且该序列与靶序列相同，认为靶序列具有特异性，当靶序列具有特异性时，目标基因组上没有脱靶位点，用该靶序列引导剪切蛋白剪切目标序列，基因编辑或基因打靶时不脱靶。
一种快速检查基因打靶特异性方法系统

[发明专利]用于消耗和富集核酸序列的方法和试剂盒-CN201980070102.1在审
发明人： A·B·罗森伯格;C·若克;G·希莉格 -专利权人：华盛顿大学
申请日： 2019-10-24 - 公布日： 2021-07-23 - 主分类号： C12N9/22 文献下载
摘要：用于富集靶核酸序列，如包含靶核酸序列的核酸分子的试剂盒和方法，和用于消耗靶核酸序列，如包含靶核酸序列的核酸分子的试剂盒和方法。在实施方案中，所述用于富集靶核酸序列的方法包括选择性降解单链样品核酸分子，如不包含靶核酸序列的那些。在实施方案中，所述用于消耗靶核酸序列的方法包括选择性降解双链样品核酸分子，如包含靶核酸序列的那些。
用于消耗富集核酸序列方法试剂盒

[发明专利]双探针核酸检测方法-CN202111011384.3在审
发明人：牛振民;赵红莉;蓝闵波;黄薇 -专利权人：上海产业技术研究院
申请日： 2021-08-31 - 公布日： 2023-03-03 - 主分类号： C12Q1/6834 文献下载
摘要：本发明一种双探针靶核酸检测方法。具体地，本发明提供检测靶序列的方法，包括步骤：(1)使用捕获链与靶序列杂交，获得捕获的靶序列，其中捕获链与靶序列的第一部分互补，(2)使用靶标链与捕获的靶序列杂交，所述靶标链识别靶序列的特征序列，所述特征序列位于靶序列的除第一部分之外的区域
探针核酸检测方法

[发明专利]基因敲除用shRNA、载体系统及应用、建立基因敲除稳转细胞系的方法-CN202210976149.8在审
发明人：许晨舟 -专利权人：嘉兴市第一医院
申请日： 2022-08-15 - 公布日： 2023-04-07 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：该shRNA靶序列选自shRNA1靶序列、shRNA2靶序列、shRNA3靶序列中的至少一种；其中，shRNA1靶序列如SEQ ID NO：1所示，shRNA2靶序列如SEQ ID NO：2所示，shRNA3靶序列如SEQ ID NO：3所示。采用本发明提供的shRNA靶序列，能够高效敲减人MCCC2基因的表达。
基因 shrna 载体系统应用建立细胞系方法

[发明专利]靶区分性探针及其用途-CN201610146451.5在审
发明人：千钟润;黄仁泽;李相吉 -专利权人： SEEGENE株式会社
申请日： 2010-09-02 - 公布日： 2017-02-22 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种靶区分性探针(TD探针)及其用途或者应用。上述靶区分性探针均通过5’‑第二次杂交部位及3’‑第一次杂交部位与靶核酸序列杂交。靶区分性探针(TD探针)与非‑靶核酸序列进行杂交时，5’‑第二次杂交部位及分离部位均不与非‑靶核酸序列杂交，因此这两个部位形成单链，这起因于低的Tm值。如上所述，上述靶区分性探针(TD探针)分别对于靶核酸序列及非‑靶核酸序列明确表示相互不同的杂交模式，由此通过更加高的特异性来区分靶核酸序列与非‑靶核酸序列。
区分探针及其用途

[发明专利]靶区分性探针及其用途-CN201080047406.5有效
发明人：千钟润;黄仁泽;李相吉 -专利权人： SEEGENE株式会社
申请日： 2010-09-02 - 公布日： 2012-11-07 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明涉及一种靶区分性探针(TD探针)及其用途或者应用。上述靶区分性探针均通过5’-第二次杂交部位及3’-第一次杂交部位与靶核酸序列杂交。靶区分性探针(TD探针)与非-靶核酸序列进行杂交时，5’-第二次杂交部位及分离部位均不与非-靶核酸序列杂交，因此这两个部位形成单链，这起因于低的Tm值。如上所述，上述靶区分性探针(TD探针)分别对于靶核酸序列及非-靶核酸序列明确表示相互不同的杂交模式，由此通过更加高的特异性来区分靶核酸序列与非-靶核酸序列。
区分探针及其用途

[发明专利]功能性核酸分子及其用途-CN201880074261.4在审
发明人： S·古斯丁奇;S·祖切利 -专利权人：意大利技术基金会;国际高等研究院
申请日： 2018-09-20 - 公布日： 2020-07-07 - 主分类号： C12N15/113 文献下载
摘要：公开了一种反式作用功能性核酸分子，其包含真核生物靶结合序列和调节序列，所述真核生物靶结合序列包含与待增强蛋白质翻译的靶mRNA序列反向互补的序列，所述调节序列包含内部核糖体进入位点(IRES)序列或内部核糖体进入位点(IRES)衍生的序列，并增强靶mRNA序列的翻译，其中所述调节序列位于靶结合序列的3'。
功能核酸分子及其用途

[发明专利]免疫受体条形码错误校正-CN201880068906.3在审
发明人：艾琳·夏姆;范珏;詹尼弗·蔡 -专利权人：贝克顿迪金森公司
申请日： 2018-09-24 - 公布日： 2020-06-05 - 主分类号： G16B20/00 文献下载
摘要：本文披露的是用于确定靶的出现的方法和系统。在一些实施例中，所述方法包括：对所述靶的推定序列进行折叠；对与所述靶的推定序列相关联的分子标记序列进行折叠；以及估计所述靶的出现，其中在对所述靶的推定序列的出现进行折叠并且对噪音分子标记序列的出现进行折叠之后，估计的所述靶的出现与跟所述测序数据中的所述靶的推定序列相关联的分子标记序列的出现相关。
免疫受体条形码错误校正

[发明专利]靶核苷酸序列的检测方法、检测靶结构及制法以及试剂盒-CN200710096698.1无效
发明人：堀内秀纪;桥本幸二 -专利权人：株式会社东芝
申请日： 2004-03-19 - 公布日： 2007-11-21 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供对检测靶核苷酸序列有用的检测靶结构的制造方法。提供由靶核酸(1)制造检测靶结构的方法。靶核酸(1)在其一部分含有靶核苷酸序列2(图1A)。按照本发明的方法，可以制造靶核酸(1)的靶核苷酸序列2以外的部分可形成双链，使用引物进行核酸的延伸的检测靶结构4(图1B)。还给出了通过本发明制造的检测用靶结构、使用该靶结构的靶核苷酸序列检测方法、检测靶结构制造用试剂盒、以及靶核苷酸序列检测用分析试剂盒。
核苷酸序列检测方法结构制法以及试剂盒

[发明专利]靶核苷酸序列的检测方法、检测靶结构及制法以及试剂盒-CN200710096697.7无效
发明人：堀内秀纪;桥本幸二 -专利权人：株式会社东芝
申请日： 2004-03-19 - 公布日： 2007-11-21 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供对检测靶核苷酸序列有用的检测靶结构的制造方法。提供由靶核酸(1)制造检测靶结构的方法。靶核酸(1)在其一部分含有靶核苷酸序列2(图1A)。按照本发明的方法，可以制造靶核酸(1)的靶核苷酸序列2以外的部分可形成双链，使用引物进行核酸的延伸的检测靶结构4(图1B)。还给出了通过本发明制造的检测用靶结构、使用该靶结构的靶核苷酸序列检测方法、检测靶结构制造用试剂盒、以及靶核苷酸序列检测用分析试剂盒。
核苷酸序列检测方法结构制法以及试剂盒

[发明专利]靶核苷酸序列的检测方法、该方法实施中使用的检测靶结构以及其制造方法、和靶核苷酸序列检测用分析试剂盒-CN200480000375.2无效
发明人：堀内秀纪;桥本幸二 -专利权人：株式会社东芝
申请日： 2004-03-19 - 公布日： 2005-11-16 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供对检测靶核苷酸序列有用的检测靶结构的制造方法。提供由靶核酸(1)制造检测靶结构的方法。靶核酸(1)在其一部分含有靶核苷酸序列2(图1A)。按照本发明的方法，可以制造靶核酸(1)的靶核苷酸序列2以外的部分可形成双链，使用引物进行核酸的延伸的检测靶结构4(图1B)。还给出了通过本发明制造的检测用靶结构、使用该靶结构的靶核苷酸序列检测方法、检测靶结构制造用试剂盒、以及靶核苷酸序列检测用分析试剂盒。
核苷酸序列检测方法实施使用结构及其制造分析试剂盒

[发明专利]靶核酸的定量方法和用于该方法的试剂盒-CN201680066232.4在审
发明人：星野辰彦;稻垣史生 -专利权人：国立研究开发法人海洋研究开发机构
申请日： 2016-11-17 - 公布日： 2018-07-17 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：本发明的目的在于提供不实施连接反应、并且消除由PCR扩增效率引起的问题、兼顾靶核酸的测序和靶核酸的定量的方法。上述目的通过下述方法得以解决：(1)使用导入有对靶核酸的序列具有特异性的序列并且在其上游导入有随机序列和已知序列的引物，实施单引物延伸反应，由此得到具有随机序列和靶核酸的序列的双链核酸；(2)以所得到的双链核酸作为模板，使用对已知序列具有特异性的引物和具有靶核酸的序列的一部分的引物实施PCR，由此得到具有随机序列和靶核酸的序列的双链核酸的扩增物；(3)使用所得到的双链核酸的扩增物，进行测序，将随机序列与靶核酸的序列一同进行解读
靶核酸双链核酸随机序列引物已知序列扩增物测序连接反应延伸反应单引物试剂盒核酸对靶解读上游

[发明专利]PCR方法-CN201680019555.8有效
发明人： D·L·沃德;C·J·马托克斯 -专利权人：索尔兹伯里NHS信托基金会
申请日： 2016-03-03 - 公布日： 2022-06-24 - 主分类号： C12Q1/686 文献下载
摘要：本发明公开了产生靶序列的扩增子构建体的方法，该方法包括提供靶序列；寡核苷酸探针，其包含通用序列，并且在其5'末端或朝向其5'末端包含能够与靶序列的3'末端之一上或者侧接靶序列的3'末端之一的序列的反向互补序列杂交的靶特异性序列；通用引物，其在3'末端上包含能够与寡核苷酸探针的通用序列杂交的序列和进行聚合酶链式反应(PCR)。
pcr 方法

[发明专利]靶序列的富集-CN201480029041.1有效
发明人： C·L·理查德 -专利权人：定向基因组学公司
申请日： 2014-03-19 - 公布日： 2020-03-20 - 主分类号： C12Q1/6806 文献下载
摘要：提供用于从核酸群体中富集靶序列的方法和组合物，其包括在溶液中使核酸群体和靶分离探针组合，其中所述靶分离探针包括亲和结合结构域；允许靶分离探针的单链区与核酸群体中的靶序列的全部或部分杂交；通过将靶分离探针与捕获结构域结合并去除非结合物质而从含靶序列的群体中选择性地固定杂交核酸；以及通过一个或多个3’单链特异性外切核酸酶从靶序列的3’端去除非靶序列。靶富集可用于检测核甘酸序列中的变异，用于检测与健康或疾病有关的表型变化。
序列富集

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
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