[发明专利]多重PCR检测柯萨奇病毒、肠道病毒71型和肠道病毒通用型用引物探针组在审
申请号: | 201711408961.6 | 申请日: | 2017-12-22 |
公开(公告)号: | CN108034764A | 公开(公告)日: | 2018-05-15 |
发明(设计)人: | 王月;王雷;林笑冬;张志强 | 申请(专利权)人: | 北京卓诚惠生生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京英创嘉友知识产权代理事务所(普通合伙) 11447 | 代理人: | 耿超;王浩然 |
地址: | 102206 北京市昌平区科*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多重 pcr 检测 柯萨奇 病毒 肠道病毒 71 通用型 引物 探针 | ||
1.多重PCR检测柯萨奇病毒A6型/A10型/A16型/肠道病毒71型/肠道病毒通用型用引物探针组,其特征在于,包括组分A和组分B,
其中,所述组分A包括:
SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A6型上游引物,
SEQ ID NO.2所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A6型下游引物,
具有SEQ ID NO.3所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A6型探针,所述柯萨奇病毒A6型探针的5’端标记有CY5发光基团,3’端标记有荧光淬灭基团BHQ3;
SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A10型上游引物,
SEQ ID NO.5所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A10型下游引物,
具有SEQ ID NO.6所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A10型探针,所述柯萨奇病毒A10型探针的5’端标记有VIC发光基团,3’端标记有荧光淬灭基团BHQ1;
SEQ ID NO.7所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A16型上游引物,
SEQ ID NO.8所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A16型下游引物,
具有SEQ ID NO.9所示核苷酸序列的柯萨奇病毒A16型探针,所述柯萨奇病毒A16型探针的5’端标记有FAM发光基团,3’端标记有荧光淬灭基团BHQ1;
所述组分B包括:
SEQ ID NO.10所示核苷酸序列的肠道病毒71型上游引物,
SEQ ID NO.11所示核苷酸序列的肠道病毒71型下游引物,
具有SEQ ID NO.12所示核苷酸序列的肠道病毒71型探针,所述肠道病毒71型探针的5’端标记有VIC发光基团,3’端标记有荧光淬灭基团BHQ1;
SEQ ID NO.13所示核苷酸序列的肠道病毒通用型上游引物,
SEQ ID NO.14所示核苷酸序列的肠道病毒通用型下游引物,
具有SEQ ID NO.15所示核苷酸序列的肠道病毒通用型探针,所述肠道病毒通用型探针的5’端标记有FAM发光基团,3’端标记有荧光淬灭基团BHQ1。
2.根据权利要求1所述引物探针组,其中,所述组分A和组分B中还分别含有阳性内质控引物探针,
阳性内质控上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示,
阳性内质控下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17所示,
阳性内质控探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.18所示,所述阳性内质控探针的5’端标记有ROX发光基团,3’端标记有荧光淬灭基团BHQ2。
3.一种多重荧光定量PCR检测柯萨奇病毒A6型/A10型/A16型/肠道病毒71型/肠道病毒通用型的检测方法,其特征在于,所述检测方法包括如下步骤:
(1)提取待测样本的总核酸;
(2)以所述总核酸为PCR模板,利用权利要求1或2所述的引物探针组对所述PCR模板进行多重荧光定量PCR扩增;
其中,所述多重荧光定量PCR同时在两个体系中进行,
在第一个体系中,利用所述组分A对所述PCR模板进行第一扩增,
在第二个体系中,利用所述组分B对所述PCR模板进行第二扩增;
(3)分别收集第一个体系中FAM、VIC、CY5和ROX荧光通道信号,收集第二个体系中VIC、FAM和ROX荧光通道信号。
4.根据权利要求3所述的检测方法,其中,所述检测方法还包括分别在两个体系中添加阳性内质控pET28a质粒模板。
5.根据权利要求3或4所述的检测方法,其中,所述引物探针组中,每条引物的最终使用浓度各自为0.3-0.6μM,每条探针的最终使用浓度各自为0.1-0.3μM。
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