[发明专利]检测DNA聚合酶活性的方法及检测试剂盒有效
申请号: | 201710324886.9 | 申请日: | 2017-05-10 |
公开(公告)号: | CN107034280B | 公开(公告)日: | 2019-12-27 |
发明(设计)人: | 蔡统聪;邓艳华;杨浩;黄田田;孙康成;王益琼 | 申请(专利权)人: | 菲鹏生物股份有限公司;广东菲鹏生物有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/48 |
代理公司: | 44224 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人: | 徐春祺 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区西丽留*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 补平 凸出 正向引物 碱基 足量 去除 诱导 标准曲线 反向引物 检测试剂 碱基互补 标准品 酶活性 酶消化 模板链 消化酶 种检测 扩增 配对 运算 延伸 | ||
本发明涉及一种检测DNA聚合酶活性的方法及检测试剂盒。该方法将待测DNA聚合酶与足量的待补平模板混合,在dNTP存在的条件下,通过待测DNA聚合酶诱导待补平模板中的第一DNA片段延伸形成与凸出片段的碱基互补的补平片段得到补平模板。补平模板中的U碱基被足量的UDG酶消化去除,得到适于PCR扩增的模板,正向引物针对凸出片段设计,反向引物针对第一DNA片段的5’端设计,诱导第一模板链扩增。而未经补平的模板经消化酶去除U碱基后则无法与正向引物配对,即不能进行PCR扩增反应。将待测DNA聚合酶的CT值带入由DNA聚合酶标准品建立的标准曲线中,运算即可获得待测DNA聚合酶的酶活性。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别是涉及一种检测DNA聚合酶活性的方法及检测试剂盒。
背景技术
DNA聚合酶(DNA polymerase)是细胞复制DNA中的重要作用酶,在特定的条件下能够诱导DNA链的复制延长。生物体内较为重要的DNA聚合酶例如有T4 DNA聚合酶、Klenow酶(又称Klenow片段,Klenow Fragment)和DNA聚合酶I(DNA-pol I)等。其中T4 DNA聚合酶是由T4噬菌体聚合酶I基因编码,具有5’-3’聚合酶活性以及3’-5’外切酶活性。T4 DNA聚合酶是基因工程技术中一种重要的工具酶,在高通量测序(next generation sequencing)文库构建的过程具有重要的作用。
传统的检测DNA聚合酶活性的方法一般采用放射性同位素法,将DNA聚合酶催化的32P标记的dNTP掺入到小牛胸腺DNA中。经过TCA沉淀、whatman滤纸过滤,通过测定酸不溶性物质中放射性的含量,从而计算聚合酶活性。这种方法易产生放射性污染、操作繁琐,难以实现高通量的检测。
发明内容
基于此,有必要提供一种非放射性、操作简便的检测DNA聚合酶活性的方法及检测试剂盒。
一种检测DNA聚合酶活性的方法,包括以下步骤:
提供待补平模板,所述待补平模板包括第一模板链和第二模板链,所述第一模板链包括第一DNA片段,所述第二模板链包括第二DNA片段以及与所述第二DNA片段5’端相连接的凸出片段,所述第二DNA片段与所述第一DNA片段碱基互补,所述凸出片段中含有U碱基;
在dNTP存在的条件下,将待测DNA聚合酶与足量的所述待补平模板混合,使得所述第一DNA片段的3’端延伸形成补平片段,得到补平模板,所述补平片段与所述凸出片段碱基互补;
将所述补平模板与正向引物、反向引物、探针、dNTP以及足量的UDG酶混合进行实时荧光定量PCR扩增反应,其中所述正向引物针对所述凸出片段设计,所述反向引物针对所述第一DNA片段的5’端设计,所述探针用于检测所述第一DNA片段;以及
获取所述实时荧光定量PCR扩增反应的CT值,将所述CT值带入由DNA聚合酶标准品建立的标准曲线中,得到所述待测DNA聚合酶的酶活性。
在一个实施方式中,所述由DNA聚合酶标准品建立的标准曲线通过如下操作得到:
将DNA聚合酶标准品进行梯度稀释,获得梯度酶活性的所述DNA聚合酶标准品;
在dNTP存在的条件下,分别将每一个酶活性的所述DNA聚合酶标准品与足量的所述待补平模板混合,得到多个补平模板,所述多个补平模板分别为每一个酶活性的所述DNA聚合酶标准品对应的补平模板;
分别将所述多个补平模板与正向引物、反向引物、探针、dNTP以及足量的UDG酶混合进行实时荧光定量PCR扩增反应;以及
获取每一个酶活性的所述DNA聚合酶标准品对应的实时荧光定量PCR扩增反应的CT值,根据所述CT值与酶活性的对应关系建立所述标准曲线。
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